Protein–RNA interactions for Protein: Q00780

Col8a1, Collagen alpha-1(VIII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col8a1Q00780 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Col8a1Q00780 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Col8a1Q00780 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col8a1Q00780 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col8a1Q00780 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col8a1Q00780 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Col8a1Q00780 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col8a1Q00780 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Col8a1Q00780 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col8a1Q00780 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Col8a1Q00780 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col8a1Q00780 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col8a1Q00780 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col8a1Q00780 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col8a1Q00780 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col8a1Q00780 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col8a1Q00780 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col8a1Q00780 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col8a1Q00780 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col8a1Q00780 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col8a1Q00780 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col8a1Q00780 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Col8a1Q00780 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col8a1Q00780 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col8a1Q00780 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col8a1Q00780 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col8a1Q00780 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col8a1Q00780 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col8a1Q00780 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col8a1Q00780 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Col8a1Q00780 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col8a1Q00780 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col8a1Q00780 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Col8a1Q00780 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col8a1Q00780 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col8a1Q00780 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col8a1Q00780 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Col8a1Q00780 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col8a1Q00780 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col8a1Q00780 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col8a1Q00780 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col8a1Q00780 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col8a1Q00780 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Col8a1Q00780 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col8a1Q00780 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col8a1Q00780 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col8a1Q00780 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col8a1Q00780 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col8a1Q00780 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col8a1Q00780 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Col8a1Q00780 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Col8a1Q00780 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col8a1Q00780 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col8a1Q00780 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col8a1Q00780 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col8a1Q00780 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col8a1Q00780 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Col8a1Q00780 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Col8a1Q00780 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Col8a1Q00780 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col8a1Q00780 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col8a1Q00780 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col8a1Q00780 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col8a1Q00780 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col8a1Q00780 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col8a1Q00780 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col8a1Q00780 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col8a1Q00780 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col8a1Q00780 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col8a1Q00780 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Col8a1Q00780 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col8a1Q00780 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col8a1Q00780 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col8a1Q00780 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col8a1Q00780 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col8a1Q00780 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col8a1Q00780 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col8a1Q00780 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col8a1Q00780 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col8a1Q00780 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col8a1Q00780 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col8a1Q00780 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col8a1Q00780 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Col8a1Q00780 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col8a1Q00780 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col8a1Q00780 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Col8a1Q00780 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Col8a1Q00780 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Col8a1Q00780 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col8a1Q00780 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col8a1Q00780 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Col8a1Q00780 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col8a1Q00780 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col8a1Q00780 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col8a1Q00780 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Col8a1Q00780 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col8a1Q00780 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col8a1Q00780 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col8a1Q00780 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Col8a1Q00780 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms