Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbp4Q00724 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbp4Q00724 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbp4Q00724 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbp4Q00724 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbp4Q00724 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbp4Q00724 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbp4Q00724 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbp4Q00724 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbp4Q00724 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbp4Q00724 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbp4Q00724 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbp4Q00724 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbp4Q00724 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbp4Q00724 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbp4Q00724 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbp4Q00724 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbp4Q00724 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbp4Q00724 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbp4Q00724 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbp4Q00724 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbp4Q00724 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbp4Q00724 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbp4Q00724 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbp4Q00724 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbp4Q00724 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbp4Q00724 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbp4Q00724 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbp4Q00724 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbp4Q00724 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbp4Q00724 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbp4Q00724 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbp4Q00724 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbp4Q00724 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbp4Q00724 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbp4Q00724 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbp4Q00724 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbp4Q00724 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbp4Q00724 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbp4Q00724 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbp4Q00724 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbp4Q00724 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbp4Q00724 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbp4Q00724 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbp4Q00724 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbp4Q00724 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbp4Q00724 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbp4Q00724 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbp4Q00724 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbp4Q00724 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbp4Q00724 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rbp4Q00724 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbp4Q00724 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbp4Q00724 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbp4Q00724 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbp4Q00724 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbp4Q00724 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbp4Q00724 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbp4Q00724 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbp4Q00724 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbp4Q00724 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbp4Q00724 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbp4Q00724 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbp4Q00724 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rbp4Q00724 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbp4Q00724 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbp4Q00724 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbp4Q00724 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbp4Q00724 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbp4Q00724 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbp4Q00724 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbp4Q00724 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbp4Q00724 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbp4Q00724 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbp4Q00724 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rbp4Q00724 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbp4Q00724 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbp4Q00724 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbp4Q00724 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbp4Q00724 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbp4Q00724 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbp4Q00724 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbp4Q00724 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbp4Q00724 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbp4Q00724 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbp4Q00724 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbp4Q00724 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbp4Q00724 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbp4Q00724 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbp4Q00724 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbp4Q00724 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rbp4Q00724 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbp4Q00724 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbp4Q00724 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbp4Q00724 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbp4Q00724 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbp4Q00724 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbp4Q00724 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbp4Q00724 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rbp4Q00724 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 847.4 ms