Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Itga4Q00651 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Itga4Q00651 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Itga4Q00651 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itga4Q00651 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itga4Q00651 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itga4Q00651 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itga4Q00651 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itga4Q00651 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itga4Q00651 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itga4Q00651 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itga4Q00651 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itga4Q00651 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itga4Q00651 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itga4Q00651 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itga4Q00651 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Itga4Q00651 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itga4Q00651 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itga4Q00651 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itga4Q00651 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itga4Q00651 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itga4Q00651 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Itga4Q00651 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itga4Q00651 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itga4Q00651 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itga4Q00651 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itga4Q00651 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itga4Q00651 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itga4Q00651 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Itga4Q00651 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Itga4Q00651 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Itga4Q00651 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Itga4Q00651 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Itga4Q00651 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Itga4Q00651 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Itga4Q00651 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Itga4Q00651 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Itga4Q00651 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Itga4Q00651 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Itga4Q00651 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Itga4Q00651 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Itga4Q00651 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Itga4Q00651 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Itga4Q00651 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Itga4Q00651 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Itga4Q00651 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Itga4Q00651 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Itga4Q00651 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Itga4Q00651 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itga4Q00651 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itga4Q00651 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itga4Q00651 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itga4Q00651 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itga4Q00651 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itga4Q00651 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Itga4Q00651 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Itga4Q00651 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Itga4Q00651 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Itga4Q00651 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Itga4Q00651 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Itga4Q00651 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Itga4Q00651 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Itga4Q00651 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Itga4Q00651 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Itga4Q00651 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Itga4Q00651 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Itga4Q00651 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Itga4Q00651 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Itga4Q00651 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Itga4Q00651 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Itga4Q00651 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Itga4Q00651 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Itga4Q00651 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Itga4Q00651 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Itga4Q00651 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Itga4Q00651 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Itga4Q00651 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Itga4Q00651 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Itga4Q00651 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Itga4Q00651 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Itga4Q00651 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Itga4Q00651 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Itga4Q00651 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itga4Q00651 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itga4Q00651 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itga4Q00651 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itga4Q00651 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itga4Q00651 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itga4Q00651 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itga4Q00651 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itga4Q00651 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Itga4Q00651 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Itga4Q00651 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Itga4Q00651 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Itga4Q00651 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Itga4Q00651 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Itga4Q00651 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Itga4Q00651 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Itga4Q00651 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Itga4Q00651 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms