Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
F8a1Q00558 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
F8a1Q00558 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
F8a1Q00558 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
F8a1Q00558 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
F8a1Q00558 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
F8a1Q00558 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
F8a1Q00558 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
F8a1Q00558 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
F8a1Q00558 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
F8a1Q00558 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
F8a1Q00558 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
F8a1Q00558 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
F8a1Q00558 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
F8a1Q00558 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
F8a1Q00558 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
F8a1Q00558 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
F8a1Q00558 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
F8a1Q00558 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
F8a1Q00558 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
F8a1Q00558 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
F8a1Q00558 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
F8a1Q00558 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
F8a1Q00558 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
F8a1Q00558 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
F8a1Q00558 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
F8a1Q00558 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
F8a1Q00558 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
F8a1Q00558 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
F8a1Q00558 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
F8a1Q00558 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
F8a1Q00558 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
F8a1Q00558 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
F8a1Q00558 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
F8a1Q00558 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
F8a1Q00558 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
F8a1Q00558 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
F8a1Q00558 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
F8a1Q00558 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
F8a1Q00558 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
F8a1Q00558 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
F8a1Q00558 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
F8a1Q00558 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
F8a1Q00558 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
F8a1Q00558 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
F8a1Q00558 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
F8a1Q00558 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
F8a1Q00558 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
F8a1Q00558 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
F8a1Q00558 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
F8a1Q00558 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
F8a1Q00558 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
F8a1Q00558 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
F8a1Q00558 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
F8a1Q00558 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
F8a1Q00558 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
F8a1Q00558 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
F8a1Q00558 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
F8a1Q00558 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
F8a1Q00558 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
F8a1Q00558 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
F8a1Q00558 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
F8a1Q00558 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
F8a1Q00558 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
F8a1Q00558 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
F8a1Q00558 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
F8a1Q00558 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
F8a1Q00558 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
F8a1Q00558 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
F8a1Q00558 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
F8a1Q00558 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
F8a1Q00558 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
F8a1Q00558 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
F8a1Q00558 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
F8a1Q00558 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
F8a1Q00558 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
F8a1Q00558 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
F8a1Q00558 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
F8a1Q00558 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
F8a1Q00558 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
F8a1Q00558 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
F8a1Q00558 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
F8a1Q00558 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
F8a1Q00558 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
F8a1Q00558 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
F8a1Q00558 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
F8a1Q00558 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
F8a1Q00558 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
F8a1Q00558 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
F8a1Q00558 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
F8a1Q00558 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
F8a1Q00558 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
F8a1Q00558 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
F8a1Q00558 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
F8a1Q00558 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
F8a1Q00558 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
F8a1Q00558 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
F8a1Q00558 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
F8a1Q00558 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
F8a1Q00558 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms