Protein–RNA interactions for Protein: Q00547

Hmmr, Hyaluronan mediated motility receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmmrQ00547 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HmmrQ00547 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HmmrQ00547 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HmmrQ00547 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HmmrQ00547 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HmmrQ00547 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HmmrQ00547 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HmmrQ00547 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HmmrQ00547 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HmmrQ00547 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HmmrQ00547 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HmmrQ00547 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HmmrQ00547 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HmmrQ00547 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
HmmrQ00547 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HmmrQ00547 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HmmrQ00547 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HmmrQ00547 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HmmrQ00547 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HmmrQ00547 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HmmrQ00547 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HmmrQ00547 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HmmrQ00547 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HmmrQ00547 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HmmrQ00547 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HmmrQ00547 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HmmrQ00547 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HmmrQ00547 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HmmrQ00547 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HmmrQ00547 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HmmrQ00547 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HmmrQ00547 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HmmrQ00547 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
HmmrQ00547 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HmmrQ00547 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HmmrQ00547 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HmmrQ00547 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HmmrQ00547 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HmmrQ00547 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HmmrQ00547 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HmmrQ00547 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HmmrQ00547 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HmmrQ00547 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HmmrQ00547 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HmmrQ00547 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HmmrQ00547 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HmmrQ00547 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HmmrQ00547 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HmmrQ00547 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HmmrQ00547 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HmmrQ00547 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HmmrQ00547 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HmmrQ00547 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
HmmrQ00547 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HmmrQ00547 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
HmmrQ00547 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HmmrQ00547 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HmmrQ00547 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HmmrQ00547 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HmmrQ00547 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HmmrQ00547 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HmmrQ00547 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HmmrQ00547 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HmmrQ00547 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
HmmrQ00547 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HmmrQ00547 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HmmrQ00547 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HmmrQ00547 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HmmrQ00547 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HmmrQ00547 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HmmrQ00547 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HmmrQ00547 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HmmrQ00547 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HmmrQ00547 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HmmrQ00547 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HmmrQ00547 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HmmrQ00547 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HmmrQ00547 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HmmrQ00547 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HmmrQ00547 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HmmrQ00547 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HmmrQ00547 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HmmrQ00547 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HmmrQ00547 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HmmrQ00547 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HmmrQ00547 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HmmrQ00547 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HmmrQ00547 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HmmrQ00547 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HmmrQ00547 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HmmrQ00547 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HmmrQ00547 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HmmrQ00547 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HmmrQ00547 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HmmrQ00547 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HmmrQ00547 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HmmrQ00547 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HmmrQ00547 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HmmrQ00547 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HmmrQ00547 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms