Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GabpaQ00422 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GabpaQ00422 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GabpaQ00422 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GabpaQ00422 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GabpaQ00422 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GabpaQ00422 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GabpaQ00422 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GabpaQ00422 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GabpaQ00422 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GabpaQ00422 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GabpaQ00422 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GabpaQ00422 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GabpaQ00422 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GabpaQ00422 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GabpaQ00422 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GabpaQ00422 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GabpaQ00422 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GabpaQ00422 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GabpaQ00422 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GabpaQ00422 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GabpaQ00422 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GabpaQ00422 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GabpaQ00422 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GabpaQ00422 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GabpaQ00422 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GabpaQ00422 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GabpaQ00422 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GabpaQ00422 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GabpaQ00422 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GabpaQ00422 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GabpaQ00422 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GabpaQ00422 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GabpaQ00422 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GabpaQ00422 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GabpaQ00422 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GabpaQ00422 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GabpaQ00422 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GabpaQ00422 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GabpaQ00422 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GabpaQ00422 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GabpaQ00422 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GabpaQ00422 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GabpaQ00422 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GabpaQ00422 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GabpaQ00422 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GabpaQ00422 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GabpaQ00422 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GabpaQ00422 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GabpaQ00422 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GabpaQ00422 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GabpaQ00422 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GabpaQ00422 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GabpaQ00422 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GabpaQ00422 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GabpaQ00422 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GabpaQ00422 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GabpaQ00422 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GabpaQ00422 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GabpaQ00422 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GabpaQ00422 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GabpaQ00422 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GabpaQ00422 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GabpaQ00422 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GabpaQ00422 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GabpaQ00422 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GabpaQ00422 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GabpaQ00422 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GabpaQ00422 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GabpaQ00422 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GabpaQ00422 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GabpaQ00422 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GabpaQ00422 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GabpaQ00422 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GabpaQ00422 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GabpaQ00422 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GabpaQ00422 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GabpaQ00422 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GabpaQ00422 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GabpaQ00422 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GabpaQ00422 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GabpaQ00422 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GabpaQ00422 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GabpaQ00422 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GabpaQ00422 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GabpaQ00422 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GabpaQ00422 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GabpaQ00422 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GabpaQ00422 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GabpaQ00422 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GabpaQ00422 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GabpaQ00422 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GabpaQ00422 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GabpaQ00422 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GabpaQ00422 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GabpaQ00422 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GabpaQ00422 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GabpaQ00422 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GabpaQ00422 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GabpaQ00422 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms