Protein–RNA interactions for Protein: P99026

Psmb4, Proteasome subunit beta type-4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb4P99026 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Psmb4P99026 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Psmb4P99026 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Psmb4P99026 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Psmb4P99026 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Psmb4P99026 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Psmb4P99026 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Psmb4P99026 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Psmb4P99026 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Psmb4P99026 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Psmb4P99026 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Psmb4P99026 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Psmb4P99026 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Psmb4P99026 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Psmb4P99026 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Psmb4P99026 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Psmb4P99026 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Psmb4P99026 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Psmb4P99026 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Psmb4P99026 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Psmb4P99026 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Psmb4P99026 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Psmb4P99026 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Psmb4P99026 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Psmb4P99026 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Psmb4P99026 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Psmb4P99026 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Psmb4P99026 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Psmb4P99026 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Psmb4P99026 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Psmb4P99026 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Psmb4P99026 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Psmb4P99026 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Psmb4P99026 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Psmb4P99026 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Psmb4P99026 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Psmb4P99026 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Psmb4P99026 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Psmb4P99026 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Psmb4P99026 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Psmb4P99026 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Psmb4P99026 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Psmb4P99026 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Psmb4P99026 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Psmb4P99026 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Psmb4P99026 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Psmb4P99026 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Psmb4P99026 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Psmb4P99026 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Psmb4P99026 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Psmb4P99026 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Psmb4P99026 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Psmb4P99026 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Psmb4P99026 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Psmb4P99026 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Psmb4P99026 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Psmb4P99026 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Psmb4P99026 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Psmb4P99026 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Psmb4P99026 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Psmb4P99026 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Psmb4P99026 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Psmb4P99026 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Psmb4P99026 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Psmb4P99026 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Psmb4P99026 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Psmb4P99026 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Psmb4P99026 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Psmb4P99026 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Psmb4P99026 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Psmb4P99026 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Psmb4P99026 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Psmb4P99026 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Psmb4P99026 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Psmb4P99026 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Psmb4P99026 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Psmb4P99026 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Psmb4P99026 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Psmb4P99026 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Psmb4P99026 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Psmb4P99026 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Psmb4P99026 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Psmb4P99026 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Psmb4P99026 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Psmb4P99026 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Psmb4P99026 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Psmb4P99026 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Psmb4P99026 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Psmb4P99026 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Psmb4P99026 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Psmb4P99026 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Psmb4P99026 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Psmb4P99026 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Psmb4P99026 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Psmb4P99026 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Psmb4P99026 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Psmb4P99026 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Psmb4P99026 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Psmb4P99026 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Psmb4P99026 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms