Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scn1bP97952 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scn1bP97952 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scn1bP97952 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scn1bP97952 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scn1bP97952 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scn1bP97952 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scn1bP97952 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Scn1bP97952 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scn1bP97952 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scn1bP97952 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scn1bP97952 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scn1bP97952 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scn1bP97952 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Scn1bP97952 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scn1bP97952 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scn1bP97952 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scn1bP97952 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scn1bP97952 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scn1bP97952 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scn1bP97952 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scn1bP97952 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scn1bP97952 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scn1bP97952 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Scn1bP97952 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scn1bP97952 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scn1bP97952 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scn1bP97952 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scn1bP97952 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scn1bP97952 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scn1bP97952 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scn1bP97952 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scn1bP97952 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scn1bP97952 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scn1bP97952 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Scn1bP97952 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scn1bP97952 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scn1bP97952 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scn1bP97952 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scn1bP97952 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scn1bP97952 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scn1bP97952 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Scn1bP97952 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Scn1bP97952 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scn1bP97952 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scn1bP97952 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scn1bP97952 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scn1bP97952 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scn1bP97952 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scn1bP97952 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scn1bP97952 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scn1bP97952 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scn1bP97952 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scn1bP97952 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scn1bP97952 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scn1bP97952 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scn1bP97952 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scn1bP97952 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scn1bP97952 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Scn1bP97952 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Scn1bP97952 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Scn1bP97952 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Scn1bP97952 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Scn1bP97952 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scn1bP97952 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scn1bP97952 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scn1bP97952 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scn1bP97952 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scn1bP97952 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scn1bP97952 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scn1bP97952 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scn1bP97952 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scn1bP97952 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scn1bP97952 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scn1bP97952 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Scn1bP97952 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scn1bP97952 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scn1bP97952 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scn1bP97952 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Scn1bP97952 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scn1bP97952 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scn1bP97952 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scn1bP97952 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scn1bP97952 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Scn1bP97952 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scn1bP97952 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scn1bP97952 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scn1bP97952 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scn1bP97952 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scn1bP97952 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scn1bP97952 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scn1bP97952 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scn1bP97952 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scn1bP97952 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scn1bP97952 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scn1bP97952 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scn1bP97952 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scn1bP97952 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scn1bP97952 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Scn1bP97952 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms