Protein–RNA interactions for Protein: P97950

Rab33a, Ras-related protein Rab-33A, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab33aP97950 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rab33aP97950 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rab33aP97950 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rab33aP97950 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rab33aP97950 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rab33aP97950 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rab33aP97950 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rab33aP97950 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rab33aP97950 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rab33aP97950 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rab33aP97950 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rab33aP97950 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rab33aP97950 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rab33aP97950 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Rab33aP97950 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rab33aP97950 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rab33aP97950 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rab33aP97950 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rab33aP97950 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rab33aP97950 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rab33aP97950 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Rab33aP97950 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rab33aP97950 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rab33aP97950 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rab33aP97950 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rab33aP97950 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rab33aP97950 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rab33aP97950 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rab33aP97950 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rab33aP97950 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rab33aP97950 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rab33aP97950 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rab33aP97950 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rab33aP97950 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rab33aP97950 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rab33aP97950 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Rab33aP97950 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rab33aP97950 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rab33aP97950 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rab33aP97950 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rab33aP97950 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rab33aP97950 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rab33aP97950 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Rab33aP97950 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rab33aP97950 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rab33aP97950 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rab33aP97950 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Rab33aP97950 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rab33aP97950 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rab33aP97950 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rab33aP97950 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rab33aP97950 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rab33aP97950 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rab33aP97950 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rab33aP97950 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rab33aP97950 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rab33aP97950 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rab33aP97950 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rab33aP97950 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rab33aP97950 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rab33aP97950 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rab33aP97950 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rab33aP97950 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rab33aP97950 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rab33aP97950 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rab33aP97950 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rab33aP97950 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rab33aP97950 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rab33aP97950 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rab33aP97950 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rab33aP97950 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Rab33aP97950 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rab33aP97950 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rab33aP97950 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rab33aP97950 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rab33aP97950 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rab33aP97950 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rab33aP97950 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rab33aP97950 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rab33aP97950 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rab33aP97950 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rab33aP97950 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rab33aP97950 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rab33aP97950 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rab33aP97950 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rab33aP97950 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rab33aP97950 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rab33aP97950 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rab33aP97950 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rab33aP97950 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rab33aP97950 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rab33aP97950 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rab33aP97950 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rab33aP97950 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rab33aP97950 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rab33aP97950 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rab33aP97950 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rab33aP97950 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rab33aP97950 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rab33aP97950 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms