Protein–RNA interactions for Protein: P97927

Lama4, Laminin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama4P97927 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lama4P97927 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lama4P97927 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lama4P97927 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lama4P97927 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lama4P97927 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lama4P97927 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lama4P97927 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lama4P97927 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lama4P97927 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lama4P97927 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lama4P97927 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lama4P97927 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lama4P97927 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lama4P97927 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lama4P97927 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lama4P97927 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lama4P97927 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Lama4P97927 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lama4P97927 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lama4P97927 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lama4P97927 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lama4P97927 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lama4P97927 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lama4P97927 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lama4P97927 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lama4P97927 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lama4P97927 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lama4P97927 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lama4P97927 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lama4P97927 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lama4P97927 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lama4P97927 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Lama4P97927 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lama4P97927 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lama4P97927 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lama4P97927 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lama4P97927 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lama4P97927 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lama4P97927 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lama4P97927 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lama4P97927 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lama4P97927 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lama4P97927 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lama4P97927 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lama4P97927 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lama4P97927 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lama4P97927 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lama4P97927 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lama4P97927 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lama4P97927 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lama4P97927 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Lama4P97927 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lama4P97927 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lama4P97927 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Lama4P97927 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lama4P97927 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lama4P97927 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lama4P97927 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Lama4P97927 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lama4P97927 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lama4P97927 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lama4P97927 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Lama4P97927 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lama4P97927 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lama4P97927 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lama4P97927 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lama4P97927 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lama4P97927 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lama4P97927 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lama4P97927 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lama4P97927 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Lama4P97927 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lama4P97927 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Lama4P97927 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Lama4P97927 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Lama4P97927 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Lama4P97927 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lama4P97927 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lama4P97927 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lama4P97927 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lama4P97927 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lama4P97927 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lama4P97927 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lama4P97927 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lama4P97927 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lama4P97927 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lama4P97927 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lama4P97927 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lama4P97927 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lama4P97927 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Lama4P97927 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lama4P97927 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Lama4P97927 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lama4P97927 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lama4P97927 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lama4P97927 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lama4P97927 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lama4P97927 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lama4P97927 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms