Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pitx2P97474 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pitx2P97474 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pitx2P97474 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pitx2P97474 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pitx2P97474 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pitx2P97474 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pitx2P97474 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pitx2P97474 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pitx2P97474 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pitx2P97474 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pitx2P97474 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pitx2P97474 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pitx2P97474 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Pitx2P97474 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pitx2P97474 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pitx2P97474 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pitx2P97474 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pitx2P97474 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pitx2P97474 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pitx2P97474 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pitx2P97474 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pitx2P97474 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pitx2P97474 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pitx2P97474 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pitx2P97474 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pitx2P97474 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pitx2P97474 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pitx2P97474 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pitx2P97474 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pitx2P97474 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pitx2P97474 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pitx2P97474 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pitx2P97474 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pitx2P97474 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pitx2P97474 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pitx2P97474 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pitx2P97474 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pitx2P97474 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pitx2P97474 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pitx2P97474 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pitx2P97474 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pitx2P97474 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pitx2P97474 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pitx2P97474 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pitx2P97474 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pitx2P97474 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pitx2P97474 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pitx2P97474 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pitx2P97474 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pitx2P97474 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pitx2P97474 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pitx2P97474 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pitx2P97474 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pitx2P97474 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pitx2P97474 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pitx2P97474 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pitx2P97474 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pitx2P97474 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pitx2P97474 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pitx2P97474 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pitx2P97474 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pitx2P97474 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pitx2P97474 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pitx2P97474 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pitx2P97474 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pitx2P97474 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pitx2P97474 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pitx2P97474 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pitx2P97474 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pitx2P97474 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pitx2P97474 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pitx2P97474 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pitx2P97474 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pitx2P97474 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pitx2P97474 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pitx2P97474 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pitx2P97474 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Pitx2P97474 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pitx2P97474 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pitx2P97474 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pitx2P97474 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pitx2P97474 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pitx2P97474 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pitx2P97474 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pitx2P97474 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Pitx2P97474 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Pitx2P97474 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pitx2P97474 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pitx2P97474 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pitx2P97474 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pitx2P97474 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pitx2P97474 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pitx2P97474 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Pitx2P97474 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pitx2P97474 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pitx2P97474 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pitx2P97474 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pitx2P97474 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pitx2P97474 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms