Protein–RNA interactions for Protein: P97443

Smyd1, Histone-lysine N-methyltransferase Smyd1, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd1P97443 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smyd1P97443 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smyd1P97443 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smyd1P97443 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smyd1P97443 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smyd1P97443 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smyd1P97443 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smyd1P97443 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Smyd1P97443 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smyd1P97443 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smyd1P97443 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smyd1P97443 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smyd1P97443 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Smyd1P97443 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smyd1P97443 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smyd1P97443 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smyd1P97443 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smyd1P97443 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smyd1P97443 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smyd1P97443 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smyd1P97443 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smyd1P97443 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smyd1P97443 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smyd1P97443 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smyd1P97443 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smyd1P97443 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smyd1P97443 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smyd1P97443 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smyd1P97443 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smyd1P97443 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smyd1P97443 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smyd1P97443 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smyd1P97443 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smyd1P97443 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smyd1P97443 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smyd1P97443 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smyd1P97443 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smyd1P97443 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smyd1P97443 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smyd1P97443 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smyd1P97443 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smyd1P97443 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smyd1P97443 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smyd1P97443 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smyd1P97443 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smyd1P97443 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smyd1P97443 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smyd1P97443 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smyd1P97443 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smyd1P97443 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smyd1P97443 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smyd1P97443 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smyd1P97443 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Smyd1P97443 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Smyd1P97443 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Smyd1P97443 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Smyd1P97443 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Smyd1P97443 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Smyd1P97443 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Smyd1P97443 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Smyd1P97443 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smyd1P97443 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smyd1P97443 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smyd1P97443 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smyd1P97443 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smyd1P97443 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smyd1P97443 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smyd1P97443 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smyd1P97443 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smyd1P97443 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smyd1P97443 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smyd1P97443 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smyd1P97443 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smyd1P97443 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smyd1P97443 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smyd1P97443 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Smyd1P97443 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Smyd1P97443 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Smyd1P97443 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Smyd1P97443 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Smyd1P97443 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Smyd1P97443 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Smyd1P97443 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Smyd1P97443 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Smyd1P97443 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Smyd1P97443 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Smyd1P97443 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Smyd1P97443 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smyd1P97443 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smyd1P97443 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smyd1P97443 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smyd1P97443 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smyd1P97443 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Smyd1P97443 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smyd1P97443 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smyd1P97443 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smyd1P97443 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smyd1P97443 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smyd1P97443 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smyd1P97443 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms