Protein–RNA interactions for Protein: P97333

Nrp1, Neuropilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 923 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrp1P97333 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nrp1P97333 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nrp1P97333 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nrp1P97333 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nrp1P97333 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nrp1P97333 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nrp1P97333 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nrp1P97333 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nrp1P97333 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Nrp1P97333 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Nrp1P97333 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Nrp1P97333 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nrp1P97333 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nrp1P97333 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nrp1P97333 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nrp1P97333 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nrp1P97333 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nrp1P97333 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nrp1P97333 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nrp1P97333 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nrp1P97333 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nrp1P97333 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nrp1P97333 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nrp1P97333 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Nrp1P97333 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Nrp1P97333 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nrp1P97333 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nrp1P97333 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nrp1P97333 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Nrp1P97333 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nrp1P97333 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nrp1P97333 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Nrp1P97333 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nrp1P97333 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Nrp1P97333 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
Nrp1P97333 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nrp1P97333 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nrp1P97333 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nrp1P97333 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nrp1P97333 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nrp1P97333 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Nrp1P97333 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Nrp1P97333 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nrp1P97333 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nrp1P97333 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nrp1P97333 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nrp1P97333 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nrp1P97333 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nrp1P97333 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nrp1P97333 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nrp1P97333 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nrp1P97333 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nrp1P97333 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nrp1P97333 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nrp1P97333 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nrp1P97333 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nrp1P97333 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nrp1P97333 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nrp1P97333 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nrp1P97333 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nrp1P97333 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nrp1P97333 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nrp1P97333 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Nrp1P97333 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nrp1P97333 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Nrp1P97333 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Nrp1P97333 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nrp1P97333 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nrp1P97333 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Nrp1P97333 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nrp1P97333 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Nrp1P97333 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Nrp1P97333 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nrp1P97333 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Nrp1P97333 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nrp1P97333 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Nrp1P97333 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nrp1P97333 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Nrp1P97333 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Nrp1P97333 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Nrp1P97333 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Nrp1P97333 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nrp1P97333 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nrp1P97333 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nrp1P97333 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nrp1P97333 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nrp1P97333 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nrp1P97333 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nrp1P97333 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nrp1P97333 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nrp1P97333 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nrp1P97333 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nrp1P97333 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nrp1P97333 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nrp1P97333 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nrp1P97333 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nrp1P97333 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nrp1P97333 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nrp1P97333 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nrp1P97333 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms