Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mesp1P97309 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Mesp1P97309 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mesp1P97309 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mesp1P97309 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mesp1P97309 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Mesp1P97309 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mesp1P97309 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mesp1P97309 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mesp1P97309 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Mesp1P97309 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mesp1P97309 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mesp1P97309 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mesp1P97309 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mesp1P97309 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mesp1P97309 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mesp1P97309 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mesp1P97309 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mesp1P97309 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mesp1P97309 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mesp1P97309 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mesp1P97309 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mesp1P97309 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mesp1P97309 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mesp1P97309 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Mesp1P97309 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Mesp1P97309 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mesp1P97309 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mesp1P97309 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mesp1P97309 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mesp1P97309 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mesp1P97309 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mesp1P97309 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mesp1P97309 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mesp1P97309 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mesp1P97309 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mesp1P97309 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mesp1P97309 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mesp1P97309 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mesp1P97309 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mesp1P97309 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mesp1P97309 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Mesp1P97309 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mesp1P97309 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mesp1P97309 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Mesp1P97309 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mesp1P97309 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mesp1P97309 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mesp1P97309 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mesp1P97309 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mesp1P97309 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mesp1P97309 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mesp1P97309 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mesp1P97309 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Mesp1P97309 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mesp1P97309 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mesp1P97309 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mesp1P97309 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mesp1P97309 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mesp1P97309 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mesp1P97309 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mesp1P97309 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Mesp1P97309 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mesp1P97309 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mesp1P97309 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mesp1P97309 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mesp1P97309 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mesp1P97309 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Mesp1P97309 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mesp1P97309 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mesp1P97309 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mesp1P97309 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Mesp1P97309 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Mesp1P97309 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Mesp1P97309 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mesp1P97309 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mesp1P97309 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mesp1P97309 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mesp1P97309 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mesp1P97309 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mesp1P97309 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mesp1P97309 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mesp1P97309 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mesp1P97309 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mesp1P97309 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mesp1P97309 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Mesp1P97309 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mesp1P97309 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mesp1P97309 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mesp1P97309 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mesp1P97309 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mesp1P97309 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mesp1P97309 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mesp1P97309 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Mesp1P97309 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mesp1P97309 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mesp1P97309 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mesp1P97309 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mesp1P97309 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mesp1P97309 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms