Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tubg1P83887 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tubg1P83887 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tubg1P83887 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tubg1P83887 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Tubg1P83887 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tubg1P83887 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tubg1P83887 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tubg1P83887 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tubg1P83887 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tubg1P83887 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tubg1P83887 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tubg1P83887 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tubg1P83887 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tubg1P83887 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tubg1P83887 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tubg1P83887 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tubg1P83887 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tubg1P83887 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tubg1P83887 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tubg1P83887 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tubg1P83887 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tubg1P83887 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tubg1P83887 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tubg1P83887 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tubg1P83887 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tubg1P83887 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tubg1P83887 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tubg1P83887 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tubg1P83887 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tubg1P83887 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tubg1P83887 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tubg1P83887 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tubg1P83887 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tubg1P83887 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tubg1P83887 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tubg1P83887 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tubg1P83887 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Tubg1P83887 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tubg1P83887 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tubg1P83887 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tubg1P83887 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Tubg1P83887 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tubg1P83887 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tubg1P83887 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tubg1P83887 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tubg1P83887 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tubg1P83887 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tubg1P83887 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tubg1P83887 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tubg1P83887 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tubg1P83887 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tubg1P83887 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tubg1P83887 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tubg1P83887 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tubg1P83887 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tubg1P83887 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tubg1P83887 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tubg1P83887 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tubg1P83887 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tubg1P83887 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tubg1P83887 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tubg1P83887 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tubg1P83887 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tubg1P83887 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tubg1P83887 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tubg1P83887 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tubg1P83887 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tubg1P83887 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Tubg1P83887 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tubg1P83887 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tubg1P83887 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tubg1P83887 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tubg1P83887 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tubg1P83887 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tubg1P83887 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tubg1P83887 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tubg1P83887 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tubg1P83887 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tubg1P83887 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tubg1P83887 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tubg1P83887 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tubg1P83887 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tubg1P83887 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tubg1P83887 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tubg1P83887 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tubg1P83887 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tubg1P83887 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tubg1P83887 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tubg1P83887 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tubg1P83887 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tubg1P83887 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tubg1P83887 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tubg1P83887 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tubg1P83887 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tubg1P83887 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tubg1P83887 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tubg1P83887 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tubg1P83887 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tubg1P83887 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms