Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gabpb2P81069 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gabpb2P81069 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gabpb2P81069 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gabpb2P81069 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gabpb2P81069 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gabpb2P81069 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gabpb2P81069 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gabpb2P81069 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gabpb2P81069 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gabpb2P81069 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gabpb2P81069 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gabpb2P81069 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gabpb2P81069 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gabpb2P81069 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gabpb2P81069 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gabpb2P81069 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gabpb2P81069 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gabpb2P81069 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Gabpb2P81069 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gabpb2P81069 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gabpb2P81069 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gabpb2P81069 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gabpb2P81069 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gabpb2P81069 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gabpb2P81069 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gabpb2P81069 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gabpb2P81069 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gabpb2P81069 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gabpb2P81069 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gabpb2P81069 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gabpb2P81069 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gabpb2P81069 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gabpb2P81069 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gabpb2P81069 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Gabpb2P81069 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gabpb2P81069 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gabpb2P81069 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gabpb2P81069 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gabpb2P81069 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gabpb2P81069 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gabpb2P81069 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gabpb2P81069 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gabpb2P81069 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gabpb2P81069 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gabpb2P81069 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gabpb2P81069 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gabpb2P81069 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gabpb2P81069 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gabpb2P81069 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gabpb2P81069 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gabpb2P81069 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gabpb2P81069 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gabpb2P81069 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gabpb2P81069 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gabpb2P81069 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gabpb2P81069 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gabpb2P81069 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Gabpb2P81069 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gabpb2P81069 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gabpb2P81069 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gabpb2P81069 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gabpb2P81069 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Gabpb2P81069 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gabpb2P81069 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gabpb2P81069 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gabpb2P81069 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gabpb2P81069 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gabpb2P81069 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gabpb2P81069 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gabpb2P81069 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gabpb2P81069 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gabpb2P81069 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gabpb2P81069 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gabpb2P81069 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gabpb2P81069 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gabpb2P81069 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gabpb2P81069 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gabpb2P81069 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gabpb2P81069 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gabpb2P81069 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gabpb2P81069 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gabpb2P81069 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gabpb2P81069 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gabpb2P81069 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gabpb2P81069 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gabpb2P81069 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gabpb2P81069 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gabpb2P81069 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gabpb2P81069 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gabpb2P81069 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gabpb2P81069 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gabpb2P81069 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gabpb2P81069 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gabpb2P81069 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gabpb2P81069 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gabpb2P81069 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Gabpb2P81069 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gabpb2P81069 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gabpb2P81069 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms