Protein–RNA interactions for Protein: P70704

Atp8a1, Phospholipid-transporting ATPase IA, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8a1P70704 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atp8a1P70704 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atp8a1P70704 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atp8a1P70704 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Atp8a1P70704 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atp8a1P70704 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Atp8a1P70704 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atp8a1P70704 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atp8a1P70704 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atp8a1P70704 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atp8a1P70704 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atp8a1P70704 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atp8a1P70704 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Atp8a1P70704 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atp8a1P70704 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atp8a1P70704 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atp8a1P70704 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atp8a1P70704 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Atp8a1P70704 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atp8a1P70704 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atp8a1P70704 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atp8a1P70704 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atp8a1P70704 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atp8a1P70704 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atp8a1P70704 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atp8a1P70704 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atp8a1P70704 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Atp8a1P70704 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atp8a1P70704 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atp8a1P70704 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atp8a1P70704 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atp8a1P70704 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atp8a1P70704 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Atp8a1P70704 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atp8a1P70704 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atp8a1P70704 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atp8a1P70704 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atp8a1P70704 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atp8a1P70704 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atp8a1P70704 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atp8a1P70704 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atp8a1P70704 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Atp8a1P70704 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atp8a1P70704 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atp8a1P70704 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atp8a1P70704 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atp8a1P70704 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atp8a1P70704 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atp8a1P70704 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atp8a1P70704 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atp8a1P70704 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Atp8a1P70704 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atp8a1P70704 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atp8a1P70704 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atp8a1P70704 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atp8a1P70704 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atp8a1P70704 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atp8a1P70704 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Atp8a1P70704 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atp8a1P70704 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atp8a1P70704 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atp8a1P70704 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atp8a1P70704 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atp8a1P70704 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atp8a1P70704 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Atp8a1P70704 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atp8a1P70704 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atp8a1P70704 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atp8a1P70704 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atp8a1P70704 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atp8a1P70704 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atp8a1P70704 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atp8a1P70704 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Atp8a1P70704 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atp8a1P70704 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atp8a1P70704 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atp8a1P70704 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Atp8a1P70704 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atp8a1P70704 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atp8a1P70704 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Atp8a1P70704 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atp8a1P70704 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atp8a1P70704 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atp8a1P70704 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atp8a1P70704 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atp8a1P70704 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atp8a1P70704 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atp8a1P70704 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atp8a1P70704 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atp8a1P70704 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atp8a1P70704 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atp8a1P70704 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atp8a1P70704 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atp8a1P70704 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atp8a1P70704 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Atp8a1P70704 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Atp8a1P70704 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Atp8a1P70704 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Atp8a1P70704 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Atp8a1P70704 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms