Protein–RNA interactions for Protein: P70700

Polr1b, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1bP70700 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Polr1bP70700 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Polr1bP70700 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Polr1bP70700 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Polr1bP70700 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Polr1bP70700 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Polr1bP70700 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Polr1bP70700 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Polr1bP70700 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Polr1bP70700 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Polr1bP70700 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Polr1bP70700 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Polr1bP70700 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Polr1bP70700 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Polr1bP70700 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Polr1bP70700 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Polr1bP70700 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Polr1bP70700 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Polr1bP70700 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Polr1bP70700 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Polr1bP70700 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Polr1bP70700 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Polr1bP70700 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Polr1bP70700 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Polr1bP70700 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Polr1bP70700 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Polr1bP70700 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Polr1bP70700 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Polr1bP70700 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Polr1bP70700 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Polr1bP70700 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Polr1bP70700 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Polr1bP70700 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Polr1bP70700 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Polr1bP70700 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Polr1bP70700 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Polr1bP70700 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Polr1bP70700 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Polr1bP70700 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Polr1bP70700 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Polr1bP70700 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Polr1bP70700 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Polr1bP70700 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Polr1bP70700 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Polr1bP70700 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Polr1bP70700 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Polr1bP70700 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Polr1bP70700 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Polr1bP70700 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Polr1bP70700 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Polr1bP70700 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Polr1bP70700 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Polr1bP70700 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Polr1bP70700 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Polr1bP70700 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Polr1bP70700 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Polr1bP70700 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Polr1bP70700 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Polr1bP70700 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Polr1bP70700 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Polr1bP70700 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Polr1bP70700 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Polr1bP70700 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Polr1bP70700 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Polr1bP70700 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Polr1bP70700 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Polr1bP70700 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Polr1bP70700 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Polr1bP70700 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Polr1bP70700 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Polr1bP70700 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Polr1bP70700 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Polr1bP70700 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Polr1bP70700 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Polr1bP70700 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Polr1bP70700 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Polr1bP70700 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Polr1bP70700 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Polr1bP70700 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Polr1bP70700 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Polr1bP70700 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Polr1bP70700 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Polr1bP70700 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Polr1bP70700 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Polr1bP70700 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Polr1bP70700 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Polr1bP70700 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Polr1bP70700 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Polr1bP70700 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Polr1bP70700 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Polr1bP70700 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Polr1bP70700 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Polr1bP70700 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Polr1bP70700 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Polr1bP70700 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Polr1bP70700 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Polr1bP70700 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Polr1bP70700 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Polr1bP70700 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Polr1bP70700 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.7 ms