Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp9xP70398 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp9xP70398 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp9xP70398 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp9xP70398 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp9xP70398 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp9xP70398 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp9xP70398 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp9xP70398 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp9xP70398 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp9xP70398 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp9xP70398 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp9xP70398 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp9xP70398 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp9xP70398 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Usp9xP70398 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp9xP70398 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp9xP70398 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp9xP70398 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp9xP70398 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp9xP70398 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp9xP70398 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp9xP70398 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp9xP70398 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Usp9xP70398 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp9xP70398 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp9xP70398 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp9xP70398 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp9xP70398 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp9xP70398 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp9xP70398 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp9xP70398 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp9xP70398 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp9xP70398 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp9xP70398 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp9xP70398 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp9xP70398 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Usp9xP70398 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp9xP70398 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp9xP70398 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp9xP70398 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp9xP70398 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp9xP70398 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp9xP70398 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp9xP70398 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Usp9xP70398 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp9xP70398 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp9xP70398 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp9xP70398 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp9xP70398 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp9xP70398 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp9xP70398 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp9xP70398 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp9xP70398 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp9xP70398 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp9xP70398 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp9xP70398 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp9xP70398 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp9xP70398 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp9xP70398 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp9xP70398 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp9xP70398 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp9xP70398 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp9xP70398 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Usp9xP70398 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp9xP70398 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp9xP70398 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp9xP70398 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp9xP70398 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp9xP70398 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp9xP70398 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp9xP70398 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp9xP70398 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp9xP70398 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp9xP70398 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp9xP70398 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp9xP70398 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp9xP70398 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp9xP70398 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Usp9xP70398 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp9xP70398 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp9xP70398 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp9xP70398 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp9xP70398 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp9xP70398 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp9xP70398 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp9xP70398 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp9xP70398 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp9xP70398 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp9xP70398 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp9xP70398 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp9xP70398 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp9xP70398 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp9xP70398 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp9xP70398 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp9xP70398 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp9xP70398 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp9xP70398 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp9xP70398 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Usp9xP70398 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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