Protein–RNA interactions for Protein: P70295

Aup1, Ancient ubiquitous protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aup1P70295 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Aup1P70295 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Aup1P70295 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Aup1P70295 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Aup1P70295 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Aup1P70295 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Aup1P70295 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Aup1P70295 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Aup1P70295 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Aup1P70295 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Aup1P70295 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Aup1P70295 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Aup1P70295 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Aup1P70295 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Aup1P70295 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Aup1P70295 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Aup1P70295 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Aup1P70295 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Aup1P70295 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Aup1P70295 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Aup1P70295 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Aup1P70295 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Aup1P70295 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Aup1P70295 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Aup1P70295 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Aup1P70295 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Aup1P70295 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Aup1P70295 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Aup1P70295 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Aup1P70295 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Aup1P70295 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Aup1P70295 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Aup1P70295 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Aup1P70295 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Aup1P70295 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Aup1P70295 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Aup1P70295 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Aup1P70295 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Aup1P70295 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Aup1P70295 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Aup1P70295 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Aup1P70295 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Aup1P70295 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Aup1P70295 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Aup1P70295 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Aup1P70295 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Aup1P70295 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Aup1P70295 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Aup1P70295 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Aup1P70295 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Aup1P70295 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Aup1P70295 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Aup1P70295 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Aup1P70295 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Aup1P70295 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Aup1P70295 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Aup1P70295 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Aup1P70295 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Aup1P70295 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Aup1P70295 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Aup1P70295 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Aup1P70295 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Aup1P70295 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Aup1P70295 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Aup1P70295 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Aup1P70295 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Aup1P70295 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Aup1P70295 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Aup1P70295 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Aup1P70295 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Aup1P70295 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Aup1P70295 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Aup1P70295 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Aup1P70295 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Aup1P70295 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Aup1P70295 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Aup1P70295 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Aup1P70295 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Aup1P70295 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Aup1P70295 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Aup1P70295 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Aup1P70295 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Aup1P70295 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Aup1P70295 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Aup1P70295 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Aup1P70295 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Aup1P70295 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Aup1P70295 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Aup1P70295 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Aup1P70295 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Aup1P70295 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Aup1P70295 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Aup1P70295 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Aup1P70295 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Aup1P70295 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Aup1P70295 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Aup1P70295 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Aup1P70295 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Aup1P70295 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Aup1P70295 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms