Protein–RNA interactions for Protein: P70278

Stra8, Stimulated by retinoic acid gene 8 protein, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra8P70278 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Stra8P70278 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Stra8P70278 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Stra8P70278 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Stra8P70278 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Stra8P70278 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Stra8P70278 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Stra8P70278 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Stra8P70278 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Stra8P70278 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Stra8P70278 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Stra8P70278 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Stra8P70278 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Stra8P70278 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Stra8P70278 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Stra8P70278 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Stra8P70278 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Stra8P70278 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Stra8P70278 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Stra8P70278 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Stra8P70278 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Stra8P70278 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Stra8P70278 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Stra8P70278 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Stra8P70278 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Stra8P70278 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Stra8P70278 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Stra8P70278 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Stra8P70278 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Stra8P70278 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Stra8P70278 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Stra8P70278 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Stra8P70278 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Stra8P70278 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Stra8P70278 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Stra8P70278 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Stra8P70278 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Stra8P70278 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Stra8P70278 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Stra8P70278 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Stra8P70278 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Stra8P70278 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Stra8P70278 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Stra8P70278 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Stra8P70278 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Stra8P70278 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Stra8P70278 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Stra8P70278 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Stra8P70278 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Stra8P70278 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Stra8P70278 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Stra8P70278 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Stra8P70278 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Stra8P70278 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Stra8P70278 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Stra8P70278 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Stra8P70278 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Stra8P70278 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Stra8P70278 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Stra8P70278 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Stra8P70278 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Stra8P70278 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Stra8P70278 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Stra8P70278 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Stra8P70278 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Stra8P70278 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Stra8P70278 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Stra8P70278 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Stra8P70278 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Stra8P70278 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Stra8P70278 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Stra8P70278 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Stra8P70278 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Stra8P70278 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Stra8P70278 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Stra8P70278 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Stra8P70278 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Stra8P70278 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Stra8P70278 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Stra8P70278 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Stra8P70278 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Stra8P70278 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Stra8P70278 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Stra8P70278 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Stra8P70278 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Stra8P70278 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Stra8P70278 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Stra8P70278 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Stra8P70278 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Stra8P70278 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Stra8P70278 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Stra8P70278 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Stra8P70278 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Stra8P70278 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Stra8P70278 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Stra8P70278 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Stra8P70278 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Stra8P70278 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Stra8P70278 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Stra8P70278 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms