Protein–RNA interactions for Protein: P70248

Myo1f, Unconventional myosin-If, mousemouse

Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo1fP70248 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Myo1fP70248 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Myo1fP70248 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Myo1fP70248 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Myo1fP70248 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Myo1fP70248 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Myo1fP70248 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Myo1fP70248 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Myo1fP70248 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Myo1fP70248 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Myo1fP70248 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Myo1fP70248 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Myo1fP70248 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Myo1fP70248 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Myo1fP70248 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Myo1fP70248 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Myo1fP70248 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Myo1fP70248 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Myo1fP70248 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Myo1fP70248 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Myo1fP70248 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Myo1fP70248 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Myo1fP70248 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Myo1fP70248 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Myo1fP70248 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Myo1fP70248 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Myo1fP70248 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Myo1fP70248 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Myo1fP70248 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Myo1fP70248 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Myo1fP70248 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Myo1fP70248 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Myo1fP70248 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Myo1fP70248 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Myo1fP70248 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Myo1fP70248 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Myo1fP70248 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Myo1fP70248 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Myo1fP70248 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Myo1fP70248 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Myo1fP70248 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Myo1fP70248 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Myo1fP70248 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Myo1fP70248 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Myo1fP70248 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Myo1fP70248 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Myo1fP70248 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Myo1fP70248 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Myo1fP70248 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Myo1fP70248 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Myo1fP70248 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Myo1fP70248 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Myo1fP70248 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Myo1fP70248 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Myo1fP70248 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Myo1fP70248 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Myo1fP70248 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Myo1fP70248 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Myo1fP70248 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Myo1fP70248 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Myo1fP70248 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Myo1fP70248 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Myo1fP70248 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Myo1fP70248 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Myo1fP70248 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Myo1fP70248 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Myo1fP70248 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Myo1fP70248 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Myo1fP70248 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Myo1fP70248 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Myo1fP70248 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Myo1fP70248 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Myo1fP70248 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Myo1fP70248 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Myo1fP70248 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Myo1fP70248 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Myo1fP70248 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Myo1fP70248 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Myo1fP70248 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Myo1fP70248 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Myo1fP70248 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Myo1fP70248 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Myo1fP70248 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Myo1fP70248 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Myo1fP70248 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Myo1fP70248 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Myo1fP70248 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Myo1fP70248 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Myo1fP70248 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Myo1fP70248 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Myo1fP70248 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Myo1fP70248 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Myo1fP70248 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Myo1fP70248 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Myo1fP70248 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Myo1fP70248 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Myo1fP70248 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Myo1fP70248 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Myo1fP70248 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Myo1fP70248 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms