Protein–RNA interactions for Protein: P70208

Plxna3, Plexin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxna3P70208 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Plxna3P70208 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Plxna3P70208 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Plxna3P70208 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Plxna3P70208 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Plxna3P70208 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Plxna3P70208 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Plxna3P70208 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Plxna3P70208 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Plxna3P70208 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Plxna3P70208 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Plxna3P70208 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Plxna3P70208 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Plxna3P70208 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Plxna3P70208 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Plxna3P70208 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Plxna3P70208 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Plxna3P70208 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Plxna3P70208 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Plxna3P70208 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Plxna3P70208 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Plxna3P70208 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Plxna3P70208 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Plxna3P70208 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Plxna3P70208 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Plxna3P70208 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Plxna3P70208 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Plxna3P70208 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Plxna3P70208 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Plxna3P70208 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Plxna3P70208 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Plxna3P70208 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Plxna3P70208 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Plxna3P70208 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Plxna3P70208 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Plxna3P70208 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Plxna3P70208 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Plxna3P70208 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Plxna3P70208 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Plxna3P70208 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Plxna3P70208 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Plxna3P70208 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Plxna3P70208 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Plxna3P70208 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Plxna3P70208 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Plxna3P70208 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Plxna3P70208 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Plxna3P70208 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Plxna3P70208 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Plxna3P70208 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Plxna3P70208 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Plxna3P70208 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Plxna3P70208 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Plxna3P70208 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Plxna3P70208 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Plxna3P70208 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Plxna3P70208 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Plxna3P70208 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Plxna3P70208 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Plxna3P70208 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Plxna3P70208 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Plxna3P70208 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Plxna3P70208 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Plxna3P70208 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Plxna3P70208 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Plxna3P70208 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Plxna3P70208 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Plxna3P70208 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Plxna3P70208 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Plxna3P70208 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Plxna3P70208 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Plxna3P70208 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Plxna3P70208 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Plxna3P70208 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Plxna3P70208 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Plxna3P70208 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Plxna3P70208 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Plxna3P70208 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Plxna3P70208 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Plxna3P70208 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Plxna3P70208 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Plxna3P70208 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Plxna3P70208 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Plxna3P70208 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Plxna3P70208 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Plxna3P70208 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Plxna3P70208 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Plxna3P70208 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Plxna3P70208 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Plxna3P70208 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Plxna3P70208 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Plxna3P70208 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Plxna3P70208 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Plxna3P70208 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Plxna3P70208 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Plxna3P70208 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Plxna3P70208 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Plxna3P70208 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Plxna3P70208 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Plxna3P70208 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms