Protein–RNA interactions for Protein: P70193

Lrig1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig1P70193 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrig1P70193 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrig1P70193 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrig1P70193 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrig1P70193 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrig1P70193 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrig1P70193 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrig1P70193 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrig1P70193 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrig1P70193 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrig1P70193 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrig1P70193 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lrig1P70193 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrig1P70193 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrig1P70193 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrig1P70193 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrig1P70193 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrig1P70193 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrig1P70193 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrig1P70193 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrig1P70193 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrig1P70193 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrig1P70193 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrig1P70193 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrig1P70193 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrig1P70193 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrig1P70193 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrig1P70193 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lrig1P70193 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrig1P70193 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrig1P70193 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrig1P70193 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrig1P70193 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrig1P70193 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrig1P70193 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrig1P70193 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrig1P70193 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrig1P70193 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrig1P70193 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrig1P70193 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrig1P70193 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Lrig1P70193 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrig1P70193 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrig1P70193 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrig1P70193 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrig1P70193 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrig1P70193 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrig1P70193 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrig1P70193 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrig1P70193 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrig1P70193 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrig1P70193 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrig1P70193 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lrig1P70193 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrig1P70193 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrig1P70193 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrig1P70193 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrig1P70193 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrig1P70193 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrig1P70193 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrig1P70193 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrig1P70193 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrig1P70193 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrig1P70193 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrig1P70193 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lrig1P70193 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrig1P70193 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrig1P70193 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrig1P70193 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrig1P70193 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrig1P70193 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrig1P70193 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrig1P70193 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrig1P70193 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrig1P70193 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrig1P70193 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrig1P70193 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lrig1P70193 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrig1P70193 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrig1P70193 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrig1P70193 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrig1P70193 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrig1P70193 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrig1P70193 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrig1P70193 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrig1P70193 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrig1P70193 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrig1P70193 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrig1P70193 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lrig1P70193 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrig1P70193 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrig1P70193 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrig1P70193 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrig1P70193 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrig1P70193 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrig1P70193 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrig1P70193 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrig1P70193 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrig1P70193 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lrig1P70193 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms