Protein–RNA interactions for Protein: P68404

Prkcb, Protein kinase C beta type, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcbP68404 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PrkcbP68404 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PrkcbP68404 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PrkcbP68404 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PrkcbP68404 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PrkcbP68404 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PrkcbP68404 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PrkcbP68404 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PrkcbP68404 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PrkcbP68404 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PrkcbP68404 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrkcbP68404 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrkcbP68404 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrkcbP68404 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrkcbP68404 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrkcbP68404 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrkcbP68404 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PrkcbP68404 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrkcbP68404 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrkcbP68404 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrkcbP68404 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrkcbP68404 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrkcbP68404 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrkcbP68404 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrkcbP68404 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PrkcbP68404 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrkcbP68404 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrkcbP68404 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrkcbP68404 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrkcbP68404 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrkcbP68404 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PrkcbP68404 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrkcbP68404 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PrkcbP68404 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrkcbP68404 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrkcbP68404 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PrkcbP68404 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PrkcbP68404 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PrkcbP68404 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PrkcbP68404 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PrkcbP68404 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PrkcbP68404 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrkcbP68404 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrkcbP68404 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PrkcbP68404 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrkcbP68404 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrkcbP68404 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrkcbP68404 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrkcbP68404 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrkcbP68404 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrkcbP68404 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PrkcbP68404 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrkcbP68404 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PrkcbP68404 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrkcbP68404 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrkcbP68404 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrkcbP68404 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrkcbP68404 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrkcbP68404 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrkcbP68404 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrkcbP68404 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PrkcbP68404 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrkcbP68404 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrkcbP68404 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PrkcbP68404 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrkcbP68404 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrkcbP68404 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrkcbP68404 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrkcbP68404 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrkcbP68404 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrkcbP68404 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PrkcbP68404 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrkcbP68404 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrkcbP68404 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrkcbP68404 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrkcbP68404 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrkcbP68404 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrkcbP68404 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrkcbP68404 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrkcbP68404 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrkcbP68404 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrkcbP68404 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrkcbP68404 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrkcbP68404 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PrkcbP68404 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrkcbP68404 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PrkcbP68404 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrkcbP68404 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrkcbP68404 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrkcbP68404 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PrkcbP68404 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrkcbP68404 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PrkcbP68404 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PrkcbP68404 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PrkcbP68404 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PrkcbP68404 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PrkcbP68404 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PrkcbP68404 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PrkcbP68404 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PrkcbP68404 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms