Protein–RNA interactions for Protein: P63166

Sumo1, Small ubiquitin-related modifier 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumo1P63166 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sumo1P63166 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sumo1P63166 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sumo1P63166 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sumo1P63166 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Sumo1P63166 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sumo1P63166 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sumo1P63166 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sumo1P63166 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sumo1P63166 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sumo1P63166 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sumo1P63166 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sumo1P63166 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sumo1P63166 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sumo1P63166 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sumo1P63166 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sumo1P63166 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sumo1P63166 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sumo1P63166 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sumo1P63166 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sumo1P63166 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sumo1P63166 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sumo1P63166 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sumo1P63166 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sumo1P63166 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sumo1P63166 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sumo1P63166 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sumo1P63166 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sumo1P63166 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sumo1P63166 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sumo1P63166 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sumo1P63166 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sumo1P63166 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sumo1P63166 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sumo1P63166 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sumo1P63166 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sumo1P63166 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sumo1P63166 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sumo1P63166 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sumo1P63166 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sumo1P63166 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sumo1P63166 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sumo1P63166 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sumo1P63166 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sumo1P63166 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sumo1P63166 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sumo1P63166 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sumo1P63166 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sumo1P63166 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sumo1P63166 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sumo1P63166 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sumo1P63166 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sumo1P63166 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sumo1P63166 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sumo1P63166 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sumo1P63166 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sumo1P63166 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sumo1P63166 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sumo1P63166 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sumo1P63166 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sumo1P63166 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sumo1P63166 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sumo1P63166 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sumo1P63166 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sumo1P63166 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sumo1P63166 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sumo1P63166 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sumo1P63166 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sumo1P63166 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sumo1P63166 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sumo1P63166 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sumo1P63166 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sumo1P63166 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sumo1P63166 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sumo1P63166 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sumo1P63166 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sumo1P63166 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sumo1P63166 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sumo1P63166 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sumo1P63166 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sumo1P63166 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sumo1P63166 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sumo1P63166 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sumo1P63166 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sumo1P63166 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sumo1P63166 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sumo1P63166 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sumo1P63166 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sumo1P63166 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sumo1P63166 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sumo1P63166 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sumo1P63166 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sumo1P63166 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sumo1P63166 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sumo1P63166 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sumo1P63166 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sumo1P63166 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sumo1P63166 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sumo1P63166 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sumo1P63166 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms