Protein–RNA interactions for Protein: P62983

Rps27a, Ubiquitin-40S ribosomal protein S27a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps27aP62983 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rps27aP62983 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rps27aP62983 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rps27aP62983 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rps27aP62983 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rps27aP62983 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rps27aP62983 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rps27aP62983 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rps27aP62983 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rps27aP62983 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rps27aP62983 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rps27aP62983 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rps27aP62983 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rps27aP62983 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rps27aP62983 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rps27aP62983 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rps27aP62983 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rps27aP62983 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rps27aP62983 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rps27aP62983 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rps27aP62983 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rps27aP62983 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rps27aP62983 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rps27aP62983 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rps27aP62983 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Rps27aP62983 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rps27aP62983 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rps27aP62983 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rps27aP62983 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rps27aP62983 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rps27aP62983 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rps27aP62983 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rps27aP62983 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rps27aP62983 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rps27aP62983 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps27aP62983 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps27aP62983 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps27aP62983 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps27aP62983 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps27aP62983 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps27aP62983 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rps27aP62983 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rps27aP62983 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rps27aP62983 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rps27aP62983 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Rps27aP62983 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rps27aP62983 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rps27aP62983 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rps27aP62983 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rps27aP62983 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rps27aP62983 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rps27aP62983 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rps27aP62983 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rps27aP62983 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rps27aP62983 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rps27aP62983 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rps27aP62983 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rps27aP62983 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rps27aP62983 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rps27aP62983 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rps27aP62983 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rps27aP62983 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rps27aP62983 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rps27aP62983 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps27aP62983 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps27aP62983 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps27aP62983 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps27aP62983 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps27aP62983 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps27aP62983 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Rps27aP62983 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps27aP62983 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps27aP62983 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps27aP62983 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps27aP62983 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps27aP62983 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps27aP62983 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps27aP62983 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps27aP62983 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps27aP62983 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rps27aP62983 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rps27aP62983 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rps27aP62983 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rps27aP62983 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rps27aP62983 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rps27aP62983 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rps27aP62983 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rps27aP62983 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rps27aP62983 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rps27aP62983 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Rps27aP62983 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rps27aP62983 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps27aP62983 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps27aP62983 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps27aP62983 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps27aP62983 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps27aP62983 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps27aP62983 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps27aP62983 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rps27aP62983 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms