Protein–RNA interactions for Protein: P62830

Rpl23, 60S ribosomal protein L23, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl23P62830 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl23P62830 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl23P62830 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl23P62830 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl23P62830 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl23P62830 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl23P62830 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl23P62830 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl23P62830 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl23P62830 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl23P62830 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl23P62830 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl23P62830 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl23P62830 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl23P62830 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl23P62830 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl23P62830 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl23P62830 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rpl23P62830 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rpl23P62830 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl23P62830 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl23P62830 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl23P62830 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl23P62830 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl23P62830 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl23P62830 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl23P62830 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl23P62830 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl23P62830 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl23P62830 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl23P62830 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl23P62830 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl23P62830 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl23P62830 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl23P62830 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl23P62830 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl23P62830 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl23P62830 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl23P62830 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl23P62830 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl23P62830 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl23P62830 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl23P62830 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl23P62830 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl23P62830 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl23P62830 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl23P62830 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl23P62830 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl23P62830 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl23P62830 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl23P62830 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl23P62830 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl23P62830 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl23P62830 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl23P62830 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl23P62830 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl23P62830 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl23P62830 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl23P62830 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl23P62830 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl23P62830 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl23P62830 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl23P62830 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl23P62830 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl23P62830 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl23P62830 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl23P62830 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl23P62830 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl23P62830 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl23P62830 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl23P62830 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl23P62830 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl23P62830 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl23P62830 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl23P62830 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl23P62830 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl23P62830 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl23P62830 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl23P62830 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl23P62830 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl23P62830 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl23P62830 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl23P62830 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl23P62830 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl23P62830 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl23P62830 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl23P62830 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl23P62830 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl23P62830 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl23P62830 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl23P62830 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl23P62830 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl23P62830 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl23P62830 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl23P62830 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl23P62830 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl23P62830 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl23P62830 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl23P62830 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl23P62830 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms