Protein–RNA interactions for Protein: P62717

Rpl18a, 60S ribosomal protein L18a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl18aP62717 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpl18aP62717 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpl18aP62717 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpl18aP62717 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpl18aP62717 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpl18aP62717 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpl18aP62717 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpl18aP62717 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpl18aP62717 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl18aP62717 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl18aP62717 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl18aP62717 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl18aP62717 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl18aP62717 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl18aP62717 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl18aP62717 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl18aP62717 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl18aP62717 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl18aP62717 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl18aP62717 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl18aP62717 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl18aP62717 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl18aP62717 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl18aP62717 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl18aP62717 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl18aP62717 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl18aP62717 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl18aP62717 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl18aP62717 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl18aP62717 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl18aP62717 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl18aP62717 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl18aP62717 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl18aP62717 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl18aP62717 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl18aP62717 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl18aP62717 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl18aP62717 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl18aP62717 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl18aP62717 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl18aP62717 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl18aP62717 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl18aP62717 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl18aP62717 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl18aP62717 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl18aP62717 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl18aP62717 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl18aP62717 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl18aP62717 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl18aP62717 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl18aP62717 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rpl18aP62717 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rpl18aP62717 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rpl18aP62717 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Rpl18aP62717 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpl18aP62717 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpl18aP62717 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpl18aP62717 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpl18aP62717 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpl18aP62717 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpl18aP62717 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpl18aP62717 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpl18aP62717 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpl18aP62717 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpl18aP62717 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl18aP62717 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl18aP62717 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl18aP62717 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl18aP62717 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl18aP62717 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl18aP62717 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl18aP62717 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl18aP62717 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl18aP62717 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl18aP62717 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl18aP62717 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl18aP62717 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl18aP62717 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl18aP62717 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl18aP62717 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl18aP62717 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl18aP62717 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl18aP62717 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl18aP62717 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl18aP62717 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl18aP62717 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl18aP62717 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl18aP62717 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl18aP62717 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl18aP62717 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl18aP62717 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl18aP62717 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl18aP62717 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl18aP62717 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl18aP62717 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl18aP62717 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl18aP62717 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl18aP62717 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl18aP62717 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Rpl18aP62717 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms