Protein–RNA interactions for Protein: P62320

Snrpd3, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd3P62320 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrpd3P62320 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrpd3P62320 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrpd3P62320 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrpd3P62320 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrpd3P62320 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrpd3P62320 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrpd3P62320 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrpd3P62320 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrpd3P62320 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snrpd3P62320 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snrpd3P62320 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snrpd3P62320 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Snrpd3P62320 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snrpd3P62320 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snrpd3P62320 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snrpd3P62320 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Snrpd3P62320 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Snrpd3P62320 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Snrpd3P62320 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snrpd3P62320 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snrpd3P62320 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snrpd3P62320 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snrpd3P62320 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snrpd3P62320 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snrpd3P62320 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snrpd3P62320 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snrpd3P62320 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snrpd3P62320 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Snrpd3P62320 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snrpd3P62320 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snrpd3P62320 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snrpd3P62320 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snrpd3P62320 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpd3P62320 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpd3P62320 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpd3P62320 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpd3P62320 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpd3P62320 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpd3P62320 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpd3P62320 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpd3P62320 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpd3P62320 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Snrpd3P62320 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpd3P62320 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Snrpd3P62320 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpd3P62320 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpd3P62320 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpd3P62320 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpd3P62320 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpd3P62320 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snrpd3P62320 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snrpd3P62320 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snrpd3P62320 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snrpd3P62320 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snrpd3P62320 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snrpd3P62320 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snrpd3P62320 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Snrpd3P62320 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Snrpd3P62320 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snrpd3P62320 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snrpd3P62320 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snrpd3P62320 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snrpd3P62320 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snrpd3P62320 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Snrpd3P62320 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snrpd3P62320 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snrpd3P62320 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snrpd3P62320 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snrpd3P62320 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Snrpd3P62320 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Snrpd3P62320 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snrpd3P62320 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snrpd3P62320 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snrpd3P62320 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snrpd3P62320 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snrpd3P62320 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snrpd3P62320 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snrpd3P62320 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snrpd3P62320 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snrpd3P62320 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snrpd3P62320 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snrpd3P62320 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snrpd3P62320 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snrpd3P62320 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snrpd3P62320 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snrpd3P62320 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snrpd3P62320 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snrpd3P62320 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snrpd3P62320 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Snrpd3P62320 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Snrpd3P62320 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Snrpd3P62320 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Snrpd3P62320 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Snrpd3P62320 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snrpd3P62320 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Snrpd3P62320 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snrpd3P62320 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snrpd3P62320 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snrpd3P62320 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms