Protein–RNA interactions for Protein: P62307

Snrpf, Small nuclear ribonucleoprotein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpfP62307 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SnrpfP62307 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SnrpfP62307 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SnrpfP62307 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SnrpfP62307 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SnrpfP62307 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SnrpfP62307 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SnrpfP62307 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SnrpfP62307 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SnrpfP62307 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SnrpfP62307 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SnrpfP62307 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SnrpfP62307 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SnrpfP62307 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SnrpfP62307 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SnrpfP62307 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SnrpfP62307 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SnrpfP62307 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SnrpfP62307 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SnrpfP62307 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SnrpfP62307 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SnrpfP62307 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SnrpfP62307 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SnrpfP62307 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SnrpfP62307 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SnrpfP62307 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SnrpfP62307 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SnrpfP62307 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SnrpfP62307 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SnrpfP62307 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SnrpfP62307 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SnrpfP62307 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SnrpfP62307 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SnrpfP62307 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SnrpfP62307 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SnrpfP62307 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SnrpfP62307 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SnrpfP62307 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SnrpfP62307 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SnrpfP62307 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SnrpfP62307 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SnrpfP62307 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SnrpfP62307 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SnrpfP62307 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SnrpfP62307 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SnrpfP62307 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SnrpfP62307 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SnrpfP62307 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SnrpfP62307 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SnrpfP62307 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SnrpfP62307 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SnrpfP62307 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SnrpfP62307 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SnrpfP62307 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SnrpfP62307 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SnrpfP62307 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SnrpfP62307 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SnrpfP62307 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SnrpfP62307 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SnrpfP62307 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SnrpfP62307 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SnrpfP62307 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SnrpfP62307 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SnrpfP62307 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SnrpfP62307 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SnrpfP62307 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SnrpfP62307 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SnrpfP62307 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SnrpfP62307 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SnrpfP62307 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SnrpfP62307 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SnrpfP62307 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SnrpfP62307 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SnrpfP62307 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SnrpfP62307 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SnrpfP62307 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SnrpfP62307 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SnrpfP62307 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SnrpfP62307 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SnrpfP62307 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SnrpfP62307 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SnrpfP62307 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SnrpfP62307 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SnrpfP62307 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SnrpfP62307 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SnrpfP62307 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SnrpfP62307 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SnrpfP62307 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SnrpfP62307 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SnrpfP62307 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SnrpfP62307 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SnrpfP62307 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SnrpfP62307 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SnrpfP62307 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SnrpfP62307 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SnrpfP62307 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SnrpfP62307 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SnrpfP62307 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SnrpfP62307 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SnrpfP62307 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
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