Protein–RNA interactions for Protein: P62301

Rps13, 40S ribosomal protein S13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps13P62301 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rps13P62301 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rps13P62301 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rps13P62301 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rps13P62301 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rps13P62301 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rps13P62301 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rps13P62301 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rps13P62301 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rps13P62301 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rps13P62301 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rps13P62301 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rps13P62301 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rps13P62301 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rps13P62301 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rps13P62301 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rps13P62301 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rps13P62301 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rps13P62301 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rps13P62301 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rps13P62301 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rps13P62301 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rps13P62301 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rps13P62301 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rps13P62301 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rps13P62301 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rps13P62301 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rps13P62301 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rps13P62301 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rps13P62301 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rps13P62301 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rps13P62301 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Rps13P62301 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rps13P62301 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rps13P62301 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rps13P62301 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rps13P62301 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rps13P62301 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rps13P62301 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rps13P62301 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rps13P62301 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rps13P62301 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rps13P62301 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rps13P62301 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rps13P62301 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rps13P62301 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rps13P62301 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rps13P62301 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rps13P62301 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rps13P62301 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rps13P62301 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rps13P62301 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rps13P62301 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rps13P62301 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rps13P62301 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rps13P62301 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rps13P62301 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rps13P62301 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rps13P62301 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rps13P62301 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rps13P62301 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rps13P62301 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rps13P62301 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rps13P62301 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rps13P62301 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rps13P62301 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rps13P62301 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rps13P62301 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rps13P62301 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rps13P62301 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rps13P62301 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rps13P62301 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rps13P62301 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rps13P62301 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rps13P62301 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rps13P62301 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rps13P62301 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Rps13P62301 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Rps13P62301 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rps13P62301 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rps13P62301 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rps13P62301 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rps13P62301 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rps13P62301 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Rps13P62301 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rps13P62301 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Rps13P62301 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rps13P62301 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rps13P62301 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rps13P62301 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Rps13P62301 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rps13P62301 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rps13P62301 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rps13P62301 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rps13P62301 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Rps13P62301 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Rps13P62301 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rps13P62301 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rps13P62301 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rps13P62301 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms