Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ufm1P61961 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ufm1P61961 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ufm1P61961 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ufm1P61961 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ufm1P61961 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ufm1P61961 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ufm1P61961 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ufm1P61961 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ufm1P61961 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ufm1P61961 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ufm1P61961 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ufm1P61961 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ufm1P61961 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ufm1P61961 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ufm1P61961 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ufm1P61961 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ufm1P61961 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ufm1P61961 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ufm1P61961 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ufm1P61961 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ufm1P61961 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ufm1P61961 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ufm1P61961 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ufm1P61961 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ufm1P61961 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ufm1P61961 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ufm1P61961 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ufm1P61961 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ufm1P61961 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ufm1P61961 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ufm1P61961 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ufm1P61961 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ufm1P61961 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ufm1P61961 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ufm1P61961 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ufm1P61961 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ufm1P61961 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ufm1P61961 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ufm1P61961 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ufm1P61961 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ufm1P61961 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ufm1P61961 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ufm1P61961 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ufm1P61961 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ufm1P61961 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ufm1P61961 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ufm1P61961 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ufm1P61961 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ufm1P61961 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ufm1P61961 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ufm1P61961 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ufm1P61961 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ufm1P61961 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ufm1P61961 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ufm1P61961 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ufm1P61961 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ufm1P61961 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ufm1P61961 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ufm1P61961 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ufm1P61961 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ufm1P61961 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ufm1P61961 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ufm1P61961 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ufm1P61961 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ufm1P61961 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ufm1P61961 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ufm1P61961 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ufm1P61961 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ufm1P61961 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ufm1P61961 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ufm1P61961 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ufm1P61961 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ufm1P61961 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ufm1P61961 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ufm1P61961 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ufm1P61961 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ufm1P61961 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ufm1P61961 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ufm1P61961 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ufm1P61961 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ufm1P61961 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ufm1P61961 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ufm1P61961 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ufm1P61961 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ufm1P61961 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ufm1P61961 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ufm1P61961 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ufm1P61961 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ufm1P61961 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ufm1P61961 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ufm1P61961 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ufm1P61961 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ufm1P61961 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ufm1P61961 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ufm1P61961 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ufm1P61961 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ufm1P61961 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ufm1P61961 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ufm1P61961 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms