Protein–RNA interactions for Protein: P61290

Psme3, Proteasome activator complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme3P61290 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psme3P61290 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psme3P61290 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Psme3P61290 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psme3P61290 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psme3P61290 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psme3P61290 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Psme3P61290 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Psme3P61290 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Psme3P61290 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Psme3P61290 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Psme3P61290 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Psme3P61290 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Psme3P61290 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Psme3P61290 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Psme3P61290 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Psme3P61290 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Psme3P61290 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Psme3P61290 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Psme3P61290 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Psme3P61290 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Psme3P61290 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Psme3P61290 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Psme3P61290 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psme3P61290 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psme3P61290 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psme3P61290 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psme3P61290 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psme3P61290 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Psme3P61290 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psme3P61290 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psme3P61290 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psme3P61290 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psme3P61290 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psme3P61290 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psme3P61290 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Psme3P61290 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psme3P61290 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psme3P61290 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Psme3P61290 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psme3P61290 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Psme3P61290 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psme3P61290 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psme3P61290 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psme3P61290 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psme3P61290 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psme3P61290 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psme3P61290 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psme3P61290 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psme3P61290 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psme3P61290 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Psme3P61290 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psme3P61290 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psme3P61290 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psme3P61290 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psme3P61290 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psme3P61290 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psme3P61290 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psme3P61290 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Psme3P61290 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Psme3P61290 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Psme3P61290 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Psme3P61290 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Psme3P61290 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Psme3P61290 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Psme3P61290 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Psme3P61290 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Psme3P61290 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Psme3P61290 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Psme3P61290 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Psme3P61290 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Psme3P61290 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Psme3P61290 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Psme3P61290 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Psme3P61290 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Psme3P61290 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Psme3P61290 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Psme3P61290 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Psme3P61290 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Psme3P61290 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Psme3P61290 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Psme3P61290 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Psme3P61290 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Psme3P61290 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Psme3P61290 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Psme3P61290 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Psme3P61290 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Psme3P61290 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Psme3P61290 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Psme3P61290 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Psme3P61290 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Psme3P61290 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Psme3P61290 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Psme3P61290 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Psme3P61290 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Psme3P61290 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Psme3P61290 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Psme3P61290 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Psme3P61290 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Psme3P61290 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms