Protein–RNA interactions for Protein: P61213

Arl4a, ADP-ribosylation factor-like protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl4aP61213 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Arl4aP61213 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Arl4aP61213 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Arl4aP61213 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Arl4aP61213 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Arl4aP61213 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Arl4aP61213 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Arl4aP61213 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Arl4aP61213 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Arl4aP61213 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Arl4aP61213 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Arl4aP61213 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Arl4aP61213 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Arl4aP61213 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Arl4aP61213 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Arl4aP61213 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Arl4aP61213 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Arl4aP61213 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Arl4aP61213 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Arl4aP61213 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Arl4aP61213 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Arl4aP61213 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Arl4aP61213 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Arl4aP61213 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Arl4aP61213 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Arl4aP61213 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Arl4aP61213 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Arl4aP61213 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Arl4aP61213 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Arl4aP61213 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Arl4aP61213 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Arl4aP61213 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Arl4aP61213 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Arl4aP61213 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Arl4aP61213 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Arl4aP61213 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Arl4aP61213 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Arl4aP61213 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Arl4aP61213 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Arl4aP61213 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Arl4aP61213 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Arl4aP61213 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Arl4aP61213 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Arl4aP61213 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Arl4aP61213 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Arl4aP61213 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Arl4aP61213 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Arl4aP61213 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Arl4aP61213 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Arl4aP61213 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Arl4aP61213 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Arl4aP61213 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Arl4aP61213 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Arl4aP61213 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Arl4aP61213 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Arl4aP61213 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Arl4aP61213 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Arl4aP61213 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Arl4aP61213 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Arl4aP61213 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Arl4aP61213 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Arl4aP61213 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Arl4aP61213 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Arl4aP61213 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Arl4aP61213 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Arl4aP61213 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Arl4aP61213 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Arl4aP61213 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Arl4aP61213 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Arl4aP61213 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Arl4aP61213 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Arl4aP61213 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Arl4aP61213 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Arl4aP61213 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Arl4aP61213 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Arl4aP61213 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Arl4aP61213 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Arl4aP61213 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Arl4aP61213 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Arl4aP61213 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Arl4aP61213 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Arl4aP61213 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Arl4aP61213 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Arl4aP61213 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Arl4aP61213 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Arl4aP61213 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Arl4aP61213 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Arl4aP61213 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Arl4aP61213 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Arl4aP61213 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Arl4aP61213 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Arl4aP61213 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Arl4aP61213 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Arl4aP61213 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Arl4aP61213 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Arl4aP61213 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Arl4aP61213 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Arl4aP61213 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Arl4aP61213 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Arl4aP61213 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms