Protein–RNA interactions for Protein: P60843

Eif4a1, Eukaryotic initiation factor 4A-I, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif4a1P60843 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Eif4a1P60843 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Eif4a1P60843 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Eif4a1P60843 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Eif4a1P60843 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Eif4a1P60843 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Eif4a1P60843 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Eif4a1P60843 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Eif4a1P60843 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Eif4a1P60843 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Eif4a1P60843 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Eif4a1P60843 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Eif4a1P60843 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Eif4a1P60843 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Eif4a1P60843 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Eif4a1P60843 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Eif4a1P60843 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Eif4a1P60843 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Eif4a1P60843 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Eif4a1P60843 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Eif4a1P60843 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Eif4a1P60843 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Eif4a1P60843 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Eif4a1P60843 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Eif4a1P60843 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Eif4a1P60843 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Eif4a1P60843 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Eif4a1P60843 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Eif4a1P60843 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Eif4a1P60843 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Eif4a1P60843 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Eif4a1P60843 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Eif4a1P60843 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Eif4a1P60843 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Eif4a1P60843 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Eif4a1P60843 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Eif4a1P60843 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Eif4a1P60843 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Eif4a1P60843 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Eif4a1P60843 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Eif4a1P60843 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Eif4a1P60843 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Eif4a1P60843 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Eif4a1P60843 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Eif4a1P60843 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Eif4a1P60843 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Eif4a1P60843 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Eif4a1P60843 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Eif4a1P60843 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Eif4a1P60843 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Eif4a1P60843 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Eif4a1P60843 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Eif4a1P60843 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Eif4a1P60843 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Eif4a1P60843 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Eif4a1P60843 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Eif4a1P60843 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Eif4a1P60843 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Eif4a1P60843 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Eif4a1P60843 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Eif4a1P60843 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Eif4a1P60843 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Eif4a1P60843 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Eif4a1P60843 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Eif4a1P60843 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Eif4a1P60843 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Eif4a1P60843 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Eif4a1P60843 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Eif4a1P60843 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Eif4a1P60843 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Eif4a1P60843 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Eif4a1P60843 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Eif4a1P60843 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Eif4a1P60843 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Eif4a1P60843 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Eif4a1P60843 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Eif4a1P60843 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Eif4a1P60843 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Eif4a1P60843 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Eif4a1P60843 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Eif4a1P60843 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Eif4a1P60843 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Eif4a1P60843 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Eif4a1P60843 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Eif4a1P60843 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Eif4a1P60843 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Eif4a1P60843 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Eif4a1P60843 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Eif4a1P60843 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Eif4a1P60843 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Eif4a1P60843 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Eif4a1P60843 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Eif4a1P60843 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Eif4a1P60843 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Eif4a1P60843 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Eif4a1P60843 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Eif4a1P60843 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Eif4a1P60843 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Eif4a1P60843 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Eif4a1P60843 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms