Protein–RNA interactions for Protein: P60229

Eif3e, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3eP60229 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Eif3eP60229 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Eif3eP60229 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Eif3eP60229 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Eif3eP60229 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Eif3eP60229 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Eif3eP60229 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Eif3eP60229 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Eif3eP60229 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Eif3eP60229 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Eif3eP60229 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Eif3eP60229 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Eif3eP60229 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Eif3eP60229 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Eif3eP60229 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Eif3eP60229 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Eif3eP60229 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Eif3eP60229 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Eif3eP60229 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Eif3eP60229 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Eif3eP60229 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Eif3eP60229 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Eif3eP60229 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Eif3eP60229 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Eif3eP60229 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Eif3eP60229 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Eif3eP60229 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Eif3eP60229 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Eif3eP60229 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Eif3eP60229 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Eif3eP60229 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Eif3eP60229 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Eif3eP60229 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Eif3eP60229 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Eif3eP60229 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Eif3eP60229 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Eif3eP60229 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Eif3eP60229 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Eif3eP60229 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Eif3eP60229 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Eif3eP60229 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Eif3eP60229 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Eif3eP60229 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Eif3eP60229 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Eif3eP60229 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Eif3eP60229 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Eif3eP60229 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Eif3eP60229 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Eif3eP60229 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Eif3eP60229 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Eif3eP60229 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Eif3eP60229 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Eif3eP60229 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Eif3eP60229 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Eif3eP60229 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Eif3eP60229 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Eif3eP60229 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Eif3eP60229 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Eif3eP60229 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Eif3eP60229 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Eif3eP60229 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Eif3eP60229 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Eif3eP60229 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Eif3eP60229 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Eif3eP60229 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Eif3eP60229 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Eif3eP60229 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Eif3eP60229 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Eif3eP60229 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Eif3eP60229 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Eif3eP60229 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Eif3eP60229 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Eif3eP60229 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Eif3eP60229 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Eif3eP60229 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Eif3eP60229 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Eif3eP60229 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Eif3eP60229 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Eif3eP60229 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Eif3eP60229 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Eif3eP60229 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Eif3eP60229 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Eif3eP60229 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Eif3eP60229 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Eif3eP60229 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Eif3eP60229 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Eif3eP60229 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Eif3eP60229 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Eif3eP60229 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Eif3eP60229 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Eif3eP60229 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Eif3eP60229 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Eif3eP60229 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Eif3eP60229 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Eif3eP60229 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Eif3eP60229 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Eif3eP60229 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Eif3eP60229 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Eif3eP60229 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Eif3eP60229 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms