Protein–RNA interactions for Protein: P59242

Cgn, Cingulin, mousemouse

Predictions only

Length 1,191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CgnP59242 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CgnP59242 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CgnP59242 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CgnP59242 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CgnP59242 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CgnP59242 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CgnP59242 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CgnP59242 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CgnP59242 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CgnP59242 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CgnP59242 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CgnP59242 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CgnP59242 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CgnP59242 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CgnP59242 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CgnP59242 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CgnP59242 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CgnP59242 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CgnP59242 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CgnP59242 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CgnP59242 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CgnP59242 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CgnP59242 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CgnP59242 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CgnP59242 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CgnP59242 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CgnP59242 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CgnP59242 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CgnP59242 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CgnP59242 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CgnP59242 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CgnP59242 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CgnP59242 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CgnP59242 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CgnP59242 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CgnP59242 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CgnP59242 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CgnP59242 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CgnP59242 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CgnP59242 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CgnP59242 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CgnP59242 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CgnP59242 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CgnP59242 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CgnP59242 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CgnP59242 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CgnP59242 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CgnP59242 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CgnP59242 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CgnP59242 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CgnP59242 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CgnP59242 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CgnP59242 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CgnP59242 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CgnP59242 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CgnP59242 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CgnP59242 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CgnP59242 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CgnP59242 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CgnP59242 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CgnP59242 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CgnP59242 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CgnP59242 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CgnP59242 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CgnP59242 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CgnP59242 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CgnP59242 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CgnP59242 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CgnP59242 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CgnP59242 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CgnP59242 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CgnP59242 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CgnP59242 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CgnP59242 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CgnP59242 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CgnP59242 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CgnP59242 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CgnP59242 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CgnP59242 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CgnP59242 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CgnP59242 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CgnP59242 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CgnP59242 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CgnP59242 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CgnP59242 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CgnP59242 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CgnP59242 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CgnP59242 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CgnP59242 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CgnP59242 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CgnP59242 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CgnP59242 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CgnP59242 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CgnP59242 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CgnP59242 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CgnP59242 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CgnP59242 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CgnP59242 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CgnP59242 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CgnP59242 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms