Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nphp4P59240 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nphp4P59240 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Nphp4P59240 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nphp4P59240 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Nphp4P59240 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Nphp4P59240 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Nphp4P59240 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Nphp4P59240 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Nphp4P59240 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Nphp4P59240 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Nphp4P59240 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nphp4P59240 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nphp4P59240 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nphp4P59240 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nphp4P59240 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nphp4P59240 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nphp4P59240 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nphp4P59240 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nphp4P59240 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nphp4P59240 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nphp4P59240 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nphp4P59240 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nphp4P59240 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Nphp4P59240 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nphp4P59240 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nphp4P59240 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Nphp4P59240 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Nphp4P59240 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Nphp4P59240 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Nphp4P59240 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Nphp4P59240 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nphp4P59240 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nphp4P59240 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nphp4P59240 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nphp4P59240 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nphp4P59240 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nphp4P59240 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nphp4P59240 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nphp4P59240 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nphp4P59240 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nphp4P59240 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nphp4P59240 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nphp4P59240 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nphp4P59240 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nphp4P59240 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nphp4P59240 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Nphp4P59240 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Nphp4P59240 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Nphp4P59240 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Nphp4P59240 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Nphp4P59240 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Nphp4P59240 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
Nphp4P59240 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Nphp4P59240 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Nphp4P59240 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nphp4P59240 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nphp4P59240 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nphp4P59240 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nphp4P59240 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nphp4P59240 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Nphp4P59240 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nphp4P59240 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nphp4P59240 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nphp4P59240 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nphp4P59240 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nphp4P59240 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nphp4P59240 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nphp4P59240 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nphp4P59240 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Nphp4P59240 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Nphp4P59240 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nphp4P59240 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nphp4P59240 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nphp4P59240 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nphp4P59240 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nphp4P59240 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nphp4P59240 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nphp4P59240 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Nphp4P59240 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Nphp4P59240 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Nphp4P59240 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Nphp4P59240 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Nphp4P59240 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Nphp4P59240 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Nphp4P59240 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Nphp4P59240 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Nphp4P59240 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Nphp4P59240 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Nphp4P59240 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Nphp4P59240 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Nphp4P59240 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Nphp4P59240 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Nphp4P59240 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Nphp4P59240 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Nphp4P59240 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Nphp4P59240 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Nphp4P59240 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Nphp4P59240 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Nphp4P59240 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC27.33■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms