Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tpm2P58774 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tpm2P58774 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tpm2P58774 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tpm2P58774 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tpm2P58774 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tpm2P58774 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tpm2P58774 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tpm2P58774 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tpm2P58774 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tpm2P58774 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tpm2P58774 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tpm2P58774 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tpm2P58774 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tpm2P58774 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tpm2P58774 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tpm2P58774 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tpm2P58774 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tpm2P58774 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tpm2P58774 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tpm2P58774 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tpm2P58774 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tpm2P58774 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tpm2P58774 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Tpm2P58774 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tpm2P58774 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tpm2P58774 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tpm2P58774 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tpm2P58774 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tpm2P58774 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tpm2P58774 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tpm2P58774 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tpm2P58774 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tpm2P58774 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tpm2P58774 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tpm2P58774 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tpm2P58774 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tpm2P58774 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tpm2P58774 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tpm2P58774 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tpm2P58774 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tpm2P58774 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tpm2P58774 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tpm2P58774 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tpm2P58774 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tpm2P58774 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tpm2P58774 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tpm2P58774 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tpm2P58774 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tpm2P58774 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tpm2P58774 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tpm2P58774 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tpm2P58774 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tpm2P58774 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tpm2P58774 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tpm2P58774 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tpm2P58774 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tpm2P58774 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tpm2P58774 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tpm2P58774 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tpm2P58774 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tpm2P58774 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tpm2P58774 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tpm2P58774 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tpm2P58774 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tpm2P58774 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tpm2P58774 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tpm2P58774 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tpm2P58774 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tpm2P58774 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tpm2P58774 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tpm2P58774 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tpm2P58774 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tpm2P58774 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tpm2P58774 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tpm2P58774 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tpm2P58774 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tpm2P58774 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tpm2P58774 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tpm2P58774 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tpm2P58774 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tpm2P58774 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tpm2P58774 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tpm2P58774 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tpm2P58774 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Tpm2P58774 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tpm2P58774 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tpm2P58774 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tpm2P58774 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tpm2P58774 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tpm2P58774 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tpm2P58774 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tpm2P58774 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tpm2P58774 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tpm2P58774 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tpm2P58774 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tpm2P58774 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tpm2P58774 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tpm2P58774 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tpm2P58774 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms