Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctdsp1P58466 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctdsp1P58466 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctdsp1P58466 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctdsp1P58466 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctdsp1P58466 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ctdsp1P58466 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctdsp1P58466 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctdsp1P58466 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctdsp1P58466 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctdsp1P58466 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctdsp1P58466 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctdsp1P58466 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctdsp1P58466 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctdsp1P58466 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctdsp1P58466 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctdsp1P58466 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctdsp1P58466 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctdsp1P58466 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctdsp1P58466 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctdsp1P58466 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctdsp1P58466 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctdsp1P58466 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctdsp1P58466 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ctdsp1P58466 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctdsp1P58466 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctdsp1P58466 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctdsp1P58466 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctdsp1P58466 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctdsp1P58466 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctdsp1P58466 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctdsp1P58466 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctdsp1P58466 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctdsp1P58466 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctdsp1P58466 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctdsp1P58466 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ctdsp1P58466 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctdsp1P58466 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctdsp1P58466 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctdsp1P58466 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctdsp1P58466 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctdsp1P58466 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctdsp1P58466 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctdsp1P58466 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctdsp1P58466 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctdsp1P58466 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctdsp1P58466 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctdsp1P58466 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctdsp1P58466 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctdsp1P58466 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ctdsp1P58466 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctdsp1P58466 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctdsp1P58466 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctdsp1P58466 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctdsp1P58466 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctdsp1P58466 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctdsp1P58466 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctdsp1P58466 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctdsp1P58466 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctdsp1P58466 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctdsp1P58466 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ctdsp1P58466 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ctdsp1P58466 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ctdsp1P58466 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ctdsp1P58466 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ctdsp1P58466 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ctdsp1P58466 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctdsp1P58466 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctdsp1P58466 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctdsp1P58466 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctdsp1P58466 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctdsp1P58466 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctdsp1P58466 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctdsp1P58466 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctdsp1P58466 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctdsp1P58466 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctdsp1P58466 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctdsp1P58466 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctdsp1P58466 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctdsp1P58466 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctdsp1P58466 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctdsp1P58466 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctdsp1P58466 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctdsp1P58466 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctdsp1P58466 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctdsp1P58466 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctdsp1P58466 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctdsp1P58466 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctdsp1P58466 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctdsp1P58466 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctdsp1P58466 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctdsp1P58466 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctdsp1P58466 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctdsp1P58466 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctdsp1P58466 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctdsp1P58466 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctdsp1P58466 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctdsp1P58466 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctdsp1P58466 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctdsp1P58466 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms