Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gsc2P56916 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gsc2P56916 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gsc2P56916 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gsc2P56916 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gsc2P56916 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gsc2P56916 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gsc2P56916 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gsc2P56916 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gsc2P56916 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gsc2P56916 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gsc2P56916 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gsc2P56916 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gsc2P56916 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gsc2P56916 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gsc2P56916 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gsc2P56916 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gsc2P56916 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gsc2P56916 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gsc2P56916 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gsc2P56916 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gsc2P56916 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gsc2P56916 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gsc2P56916 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gsc2P56916 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gsc2P56916 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gsc2P56916 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gsc2P56916 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gsc2P56916 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gsc2P56916 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gsc2P56916 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gsc2P56916 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gsc2P56916 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gsc2P56916 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gsc2P56916 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gsc2P56916 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gsc2P56916 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gsc2P56916 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gsc2P56916 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gsc2P56916 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gsc2P56916 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gsc2P56916 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gsc2P56916 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gsc2P56916 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gsc2P56916 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gsc2P56916 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gsc2P56916 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gsc2P56916 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gsc2P56916 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gsc2P56916 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gsc2P56916 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gsc2P56916 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gsc2P56916 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gsc2P56916 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gsc2P56916 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gsc2P56916 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gsc2P56916 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gsc2P56916 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gsc2P56916 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gsc2P56916 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gsc2P56916 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gsc2P56916 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gsc2P56916 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gsc2P56916 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gsc2P56916 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gsc2P56916 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gsc2P56916 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gsc2P56916 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gsc2P56916 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gsc2P56916 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gsc2P56916 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gsc2P56916 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gsc2P56916 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gsc2P56916 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gsc2P56916 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gsc2P56916 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gsc2P56916 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gsc2P56916 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gsc2P56916 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gsc2P56916 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gsc2P56916 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gsc2P56916 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gsc2P56916 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gsc2P56916 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gsc2P56916 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gsc2P56916 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gsc2P56916 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gsc2P56916 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gsc2P56916 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gsc2P56916 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gsc2P56916 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gsc2P56916 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gsc2P56916 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gsc2P56916 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gsc2P56916 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gsc2P56916 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gsc2P56916 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gsc2P56916 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gsc2P56916 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gsc2P56916 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms