Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Bace1P56818 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Bace1P56818 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Bace1P56818 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Bace1P56818 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Bace1P56818 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Bace1P56818 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Bace1P56818 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Bace1P56818 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Bace1P56818 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Bace1P56818 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Bace1P56818 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Bace1P56818 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Bace1P56818 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Bace1P56818 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Bace1P56818 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Bace1P56818 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Bace1P56818 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Bace1P56818 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Bace1P56818 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Bace1P56818 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Bace1P56818 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Bace1P56818 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Bace1P56818 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Bace1P56818 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Bace1P56818 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Bace1P56818 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Bace1P56818 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Bace1P56818 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Bace1P56818 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Bace1P56818 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Bace1P56818 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Bace1P56818 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Bace1P56818 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Bace1P56818 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Bace1P56818 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Bace1P56818 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Bace1P56818 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Bace1P56818 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Bace1P56818 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Bace1P56818 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Bace1P56818 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bace1P56818 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bace1P56818 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bace1P56818 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bace1P56818 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bace1P56818 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bace1P56818 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bace1P56818 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bace1P56818 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bace1P56818 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bace1P56818 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Bace1P56818 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bace1P56818 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bace1P56818 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bace1P56818 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bace1P56818 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bace1P56818 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bace1P56818 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bace1P56818 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bace1P56818 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bace1P56818 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bace1P56818 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bace1P56818 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bace1P56818 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bace1P56818 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bace1P56818 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bace1P56818 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bace1P56818 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bace1P56818 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bace1P56818 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Bace1P56818 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Bace1P56818 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Bace1P56818 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Bace1P56818 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Bace1P56818 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Bace1P56818 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Bace1P56818 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Bace1P56818 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Bace1P56818 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Bace1P56818 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Bace1P56818 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bace1P56818 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bace1P56818 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bace1P56818 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bace1P56818 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bace1P56818 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Bace1P56818 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Bace1P56818 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Bace1P56818 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Bace1P56818 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Bace1P56818 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Bace1P56818 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Bace1P56818 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Bace1P56818 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Bace1P56818 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Bace1P56818 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Bace1P56818 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Bace1P56818 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Bace1P56818 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms