Protein–RNA interactions for Protein: P56546

Ctbp2, C-terminal-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctbp2P56546 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctbp2P56546 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctbp2P56546 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctbp2P56546 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctbp2P56546 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctbp2P56546 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ctbp2P56546 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctbp2P56546 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctbp2P56546 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctbp2P56546 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctbp2P56546 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctbp2P56546 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctbp2P56546 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctbp2P56546 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctbp2P56546 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctbp2P56546 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctbp2P56546 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctbp2P56546 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctbp2P56546 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctbp2P56546 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ctbp2P56546 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctbp2P56546 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctbp2P56546 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctbp2P56546 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctbp2P56546 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctbp2P56546 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctbp2P56546 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctbp2P56546 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctbp2P56546 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctbp2P56546 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctbp2P56546 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctbp2P56546 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctbp2P56546 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctbp2P56546 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctbp2P56546 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctbp2P56546 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctbp2P56546 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctbp2P56546 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctbp2P56546 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctbp2P56546 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctbp2P56546 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctbp2P56546 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctbp2P56546 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctbp2P56546 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctbp2P56546 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctbp2P56546 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctbp2P56546 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctbp2P56546 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctbp2P56546 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctbp2P56546 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctbp2P56546 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctbp2P56546 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctbp2P56546 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctbp2P56546 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctbp2P56546 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctbp2P56546 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctbp2P56546 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctbp2P56546 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctbp2P56546 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctbp2P56546 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctbp2P56546 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctbp2P56546 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctbp2P56546 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctbp2P56546 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctbp2P56546 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctbp2P56546 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctbp2P56546 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctbp2P56546 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctbp2P56546 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctbp2P56546 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctbp2P56546 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctbp2P56546 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctbp2P56546 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctbp2P56546 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctbp2P56546 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctbp2P56546 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctbp2P56546 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctbp2P56546 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctbp2P56546 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctbp2P56546 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctbp2P56546 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctbp2P56546 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctbp2P56546 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctbp2P56546 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctbp2P56546 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctbp2P56546 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctbp2P56546 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctbp2P56546 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctbp2P56546 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctbp2P56546 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctbp2P56546 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctbp2P56546 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctbp2P56546 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctbp2P56546 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctbp2P56546 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctbp2P56546 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctbp2P56546 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctbp2P56546 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctbp2P56546 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctbp2P56546 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms