Protein–RNA interactions for Protein: P56391

Cox6b1, Cytochrome c oxidase subunit 6B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox6b1P56391 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cox6b1P56391 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cox6b1P56391 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cox6b1P56391 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cox6b1P56391 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cox6b1P56391 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cox6b1P56391 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cox6b1P56391 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cox6b1P56391 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cox6b1P56391 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cox6b1P56391 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cox6b1P56391 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cox6b1P56391 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cox6b1P56391 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cox6b1P56391 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cox6b1P56391 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cox6b1P56391 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cox6b1P56391 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cox6b1P56391 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cox6b1P56391 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cox6b1P56391 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cox6b1P56391 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cox6b1P56391 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cox6b1P56391 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cox6b1P56391 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cox6b1P56391 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cox6b1P56391 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cox6b1P56391 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cox6b1P56391 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cox6b1P56391 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cox6b1P56391 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cox6b1P56391 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cox6b1P56391 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cox6b1P56391 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cox6b1P56391 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cox6b1P56391 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cox6b1P56391 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cox6b1P56391 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cox6b1P56391 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cox6b1P56391 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cox6b1P56391 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cox6b1P56391 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cox6b1P56391 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cox6b1P56391 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cox6b1P56391 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cox6b1P56391 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cox6b1P56391 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cox6b1P56391 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cox6b1P56391 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cox6b1P56391 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cox6b1P56391 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cox6b1P56391 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cox6b1P56391 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cox6b1P56391 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cox6b1P56391 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cox6b1P56391 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cox6b1P56391 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cox6b1P56391 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cox6b1P56391 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cox6b1P56391 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cox6b1P56391 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cox6b1P56391 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cox6b1P56391 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cox6b1P56391 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cox6b1P56391 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cox6b1P56391 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cox6b1P56391 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cox6b1P56391 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cox6b1P56391 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cox6b1P56391 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cox6b1P56391 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cox6b1P56391 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cox6b1P56391 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cox6b1P56391 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cox6b1P56391 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cox6b1P56391 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cox6b1P56391 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cox6b1P56391 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cox6b1P56391 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cox6b1P56391 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cox6b1P56391 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cox6b1P56391 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cox6b1P56391 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cox6b1P56391 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cox6b1P56391 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cox6b1P56391 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cox6b1P56391 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cox6b1P56391 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cox6b1P56391 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cox6b1P56391 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cox6b1P56391 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cox6b1P56391 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cox6b1P56391 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cox6b1P56391 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cox6b1P56391 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cox6b1P56391 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cox6b1P56391 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cox6b1P56391 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cox6b1P56391 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cox6b1P56391 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms