Protein–RNA interactions for Protein: P56389

Cda, Cytidine deaminase, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CdaP56389 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CdaP56389 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CdaP56389 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CdaP56389 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CdaP56389 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CdaP56389 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CdaP56389 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CdaP56389 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CdaP56389 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CdaP56389 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CdaP56389 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CdaP56389 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CdaP56389 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CdaP56389 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CdaP56389 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CdaP56389 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CdaP56389 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CdaP56389 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CdaP56389 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CdaP56389 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CdaP56389 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CdaP56389 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CdaP56389 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CdaP56389 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CdaP56389 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CdaP56389 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CdaP56389 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CdaP56389 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CdaP56389 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CdaP56389 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CdaP56389 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CdaP56389 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CdaP56389 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CdaP56389 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CdaP56389 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CdaP56389 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CdaP56389 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CdaP56389 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CdaP56389 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CdaP56389 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CdaP56389 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CdaP56389 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CdaP56389 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CdaP56389 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CdaP56389 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CdaP56389 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CdaP56389 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CdaP56389 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CdaP56389 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CdaP56389 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CdaP56389 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CdaP56389 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CdaP56389 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CdaP56389 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CdaP56389 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CdaP56389 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CdaP56389 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CdaP56389 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CdaP56389 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CdaP56389 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CdaP56389 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CdaP56389 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CdaP56389 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CdaP56389 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CdaP56389 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CdaP56389 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CdaP56389 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CdaP56389 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CdaP56389 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CdaP56389 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CdaP56389 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CdaP56389 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CdaP56389 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CdaP56389 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CdaP56389 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CdaP56389 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CdaP56389 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CdaP56389 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CdaP56389 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CdaP56389 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CdaP56389 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CdaP56389 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CdaP56389 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CdaP56389 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
CdaP56389 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CdaP56389 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CdaP56389 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CdaP56389 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CdaP56389 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CdaP56389 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CdaP56389 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CdaP56389 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CdaP56389 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CdaP56389 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CdaP56389 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CdaP56389 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CdaP56389 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CdaP56389 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CdaP56389 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CdaP56389 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms