Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rrp1P56183 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rrp1P56183 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rrp1P56183 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rrp1P56183 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rrp1P56183 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rrp1P56183 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rrp1P56183 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rrp1P56183 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rrp1P56183 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rrp1P56183 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rrp1P56183 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rrp1P56183 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rrp1P56183 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rrp1P56183 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rrp1P56183 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rrp1P56183 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rrp1P56183 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Rrp1P56183 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rrp1P56183 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rrp1P56183 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rrp1P56183 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rrp1P56183 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rrp1P56183 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rrp1P56183 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rrp1P56183 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rrp1P56183 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rrp1P56183 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rrp1P56183 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rrp1P56183 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rrp1P56183 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rrp1P56183 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rrp1P56183 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rrp1P56183 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rrp1P56183 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rrp1P56183 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rrp1P56183 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rrp1P56183 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rrp1P56183 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rrp1P56183 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rrp1P56183 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rrp1P56183 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rrp1P56183 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rrp1P56183 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rrp1P56183 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rrp1P56183 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rrp1P56183 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rrp1P56183 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rrp1P56183 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rrp1P56183 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rrp1P56183 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rrp1P56183 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Rrp1P56183 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rrp1P56183 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rrp1P56183 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rrp1P56183 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rrp1P56183 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rrp1P56183 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rrp1P56183 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rrp1P56183 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rrp1P56183 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rrp1P56183 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rrp1P56183 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rrp1P56183 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rrp1P56183 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rrp1P56183 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rrp1P56183 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rrp1P56183 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rrp1P56183 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rrp1P56183 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rrp1P56183 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Rrp1P56183 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rrp1P56183 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rrp1P56183 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rrp1P56183 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rrp1P56183 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rrp1P56183 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rrp1P56183 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rrp1P56183 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rrp1P56183 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rrp1P56183 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rrp1P56183 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rrp1P56183 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rrp1P56183 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rrp1P56183 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rrp1P56183 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rrp1P56183 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Rrp1P56183 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rrp1P56183 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rrp1P56183 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rrp1P56183 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rrp1P56183 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rrp1P56183 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rrp1P56183 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rrp1P56183 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rrp1P56183 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rrp1P56183 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rrp1P56183 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rrp1P56183 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rrp1P56183 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms