Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sh3bp1P55194 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sh3bp1P55194 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sh3bp1P55194 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sh3bp1P55194 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sh3bp1P55194 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sh3bp1P55194 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Sh3bp1P55194 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sh3bp1P55194 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Sh3bp1P55194 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sh3bp1P55194 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Sh3bp1P55194 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sh3bp1P55194 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sh3bp1P55194 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sh3bp1P55194 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sh3bp1P55194 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sh3bp1P55194 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sh3bp1P55194 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sh3bp1P55194 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sh3bp1P55194 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sh3bp1P55194 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sh3bp1P55194 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sh3bp1P55194 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sh3bp1P55194 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sh3bp1P55194 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sh3bp1P55194 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sh3bp1P55194 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sh3bp1P55194 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sh3bp1P55194 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sh3bp1P55194 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sh3bp1P55194 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sh3bp1P55194 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sh3bp1P55194 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sh3bp1P55194 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sh3bp1P55194 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sh3bp1P55194 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sh3bp1P55194 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sh3bp1P55194 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sh3bp1P55194 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sh3bp1P55194 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sh3bp1P55194 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sh3bp1P55194 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sh3bp1P55194 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sh3bp1P55194 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sh3bp1P55194 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sh3bp1P55194 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sh3bp1P55194 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sh3bp1P55194 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sh3bp1P55194 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sh3bp1P55194 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sh3bp1P55194 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sh3bp1P55194 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sh3bp1P55194 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sh3bp1P55194 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sh3bp1P55194 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sh3bp1P55194 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sh3bp1P55194 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sh3bp1P55194 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Sh3bp1P55194 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sh3bp1P55194 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sh3bp1P55194 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sh3bp1P55194 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sh3bp1P55194 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Sh3bp1P55194 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Sh3bp1P55194 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sh3bp1P55194 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sh3bp1P55194 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sh3bp1P55194 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sh3bp1P55194 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sh3bp1P55194 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Sh3bp1P55194 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sh3bp1P55194 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sh3bp1P55194 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sh3bp1P55194 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sh3bp1P55194 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sh3bp1P55194 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sh3bp1P55194 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sh3bp1P55194 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sh3bp1P55194 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sh3bp1P55194 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sh3bp1P55194 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sh3bp1P55194 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sh3bp1P55194 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sh3bp1P55194 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sh3bp1P55194 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sh3bp1P55194 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sh3bp1P55194 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sh3bp1P55194 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sh3bp1P55194 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sh3bp1P55194 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sh3bp1P55194 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sh3bp1P55194 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sh3bp1P55194 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sh3bp1P55194 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sh3bp1P55194 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sh3bp1P55194 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sh3bp1P55194 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sh3bp1P55194 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sh3bp1P55194 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sh3bp1P55194 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
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