Protein–RNA interactions for Protein: P54761

Ephb4, Ephrin type-B receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb4P54761 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ephb4P54761 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ephb4P54761 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ephb4P54761 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ephb4P54761 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ephb4P54761 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ephb4P54761 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ephb4P54761 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ephb4P54761 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ephb4P54761 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ephb4P54761 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ephb4P54761 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ephb4P54761 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ephb4P54761 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ephb4P54761 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ephb4P54761 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ephb4P54761 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ephb4P54761 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ephb4P54761 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ephb4P54761 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ephb4P54761 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ephb4P54761 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ephb4P54761 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ephb4P54761 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ephb4P54761 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ephb4P54761 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ephb4P54761 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ephb4P54761 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ephb4P54761 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ephb4P54761 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ephb4P54761 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ephb4P54761 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ephb4P54761 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ephb4P54761 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ephb4P54761 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ephb4P54761 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ephb4P54761 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ephb4P54761 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ephb4P54761 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ephb4P54761 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ephb4P54761 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ephb4P54761 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ephb4P54761 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ephb4P54761 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ephb4P54761 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ephb4P54761 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ephb4P54761 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ephb4P54761 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ephb4P54761 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ephb4P54761 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ephb4P54761 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ephb4P54761 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ephb4P54761 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ephb4P54761 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ephb4P54761 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ephb4P54761 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ephb4P54761 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ephb4P54761 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ephb4P54761 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ephb4P54761 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ephb4P54761 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ephb4P54761 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ephb4P54761 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ephb4P54761 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ephb4P54761 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ephb4P54761 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ephb4P54761 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ephb4P54761 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ephb4P54761 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ephb4P54761 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ephb4P54761 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ephb4P54761 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ephb4P54761 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ephb4P54761 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ephb4P54761 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ephb4P54761 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ephb4P54761 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ephb4P54761 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ephb4P54761 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ephb4P54761 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ephb4P54761 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ephb4P54761 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ephb4P54761 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ephb4P54761 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ephb4P54761 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ephb4P54761 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ephb4P54761 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ephb4P54761 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ephb4P54761 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ephb4P54761 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ephb4P54761 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ephb4P54761 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ephb4P54761 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ephb4P54761 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ephb4P54761 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ephb4P54761 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ephb4P54761 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ephb4P54761 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ephb4P54761 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ephb4P54761 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms