Protein–RNA interactions for Protein: P54731

Faf1, FAS-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Faf1P54731 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Faf1P54731 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Faf1P54731 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Faf1P54731 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Faf1P54731 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Faf1P54731 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Faf1P54731 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Faf1P54731 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Faf1P54731 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Faf1P54731 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Faf1P54731 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Faf1P54731 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Faf1P54731 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Faf1P54731 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Faf1P54731 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Faf1P54731 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Faf1P54731 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Faf1P54731 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Faf1P54731 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Faf1P54731 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Faf1P54731 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Faf1P54731 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Faf1P54731 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Faf1P54731 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Faf1P54731 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Faf1P54731 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Faf1P54731 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Faf1P54731 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Faf1P54731 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Faf1P54731 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Faf1P54731 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Faf1P54731 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Faf1P54731 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Faf1P54731 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Faf1P54731 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Faf1P54731 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Faf1P54731 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Faf1P54731 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Faf1P54731 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Faf1P54731 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Faf1P54731 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Faf1P54731 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Faf1P54731 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Faf1P54731 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Faf1P54731 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Faf1P54731 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Faf1P54731 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Faf1P54731 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Faf1P54731 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Faf1P54731 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Faf1P54731 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Faf1P54731 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Faf1P54731 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Faf1P54731 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Faf1P54731 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Faf1P54731 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Faf1P54731 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Faf1P54731 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Faf1P54731 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Faf1P54731 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Faf1P54731 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Faf1P54731 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Faf1P54731 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Faf1P54731 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Faf1P54731 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Faf1P54731 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Faf1P54731 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Faf1P54731 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Faf1P54731 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Faf1P54731 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Faf1P54731 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Faf1P54731 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Faf1P54731 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Faf1P54731 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Faf1P54731 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Faf1P54731 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Faf1P54731 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Faf1P54731 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Faf1P54731 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Faf1P54731 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Faf1P54731 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Faf1P54731 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Faf1P54731 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Faf1P54731 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Faf1P54731 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Faf1P54731 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Faf1P54731 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Faf1P54731 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Faf1P54731 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Faf1P54731 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Faf1P54731 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Faf1P54731 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Faf1P54731 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Faf1P54731 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Faf1P54731 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Faf1P54731 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Faf1P54731 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Faf1P54731 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Faf1P54731 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Faf1P54731 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms